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一种基于二代和三代ONT技术进行宏基因组组装方法

摘要

本发明实施例提供一种基于二代和三代ONT技术进行宏基因组组装方法,方法包括:利用三代ONT测序的reads进行自身比对,找到不同数据间的重叠部分overlap;根据不同数据间的重叠部分overlap对不同数据进行组装,得到组装后的数据;利用三代数据对所述组装后的数据进行自身纠错;利用二代测序继续进行纠错,得到最终的组装结果。本发明实施例先利用ONT三代测序的reads进行自身比对,找到数据间的overlap进行组装,组装后利用三代数据进行自身纠错,之后再利用二代测序继续进行纠错,从而提高组装结果的准确性。

著录项

  • 公开/公告号CN111564181A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-08-21

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京百迈客生物科技有限公司;

    申请/专利号CN202010255667.1

  • 发明设计人 郑洪坤;龚雪情;王凡;

    申请日2020-04-02

  • 分类号G16B30/20(20190101);G16B30/10(20190101);

  • 代理机构11002 北京路浩知识产权代理有限公司;

  • 代理人白淑君

  • 地址 101300 北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢5层508室

  • 入库时间 2023-12-17 11:07:24

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-08-21

    公开

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