建立分子结构与活性数据库的方法

摘要

本发明提供建立分子结构与活性数据库的方法，从化合物数据库上进行搜索获取与选定靶点相关的所有化合物，并记录化合物的相关信息，按照需求将外部数据转换成为标准化格式；对数据进行校验核对确保数据的准确性；将校验通过存储的临时文件，上传至MongoDB数据库中；用户通过SDK向数据检索模块发送检索请求，根据用户的需求选取某一特定的靶点，提取包含该靶点的全部数据；调用Jupyter中的构效分析模块，根据用户所输入的母核结构以及相似度的要求，对该结构与数据库中的结构进行亚结构匹配以及相似度比较计算。本发明适用于计算机辅助药物设计以及虚拟筛选等药物筛选，实现了半自动化收集数据以及清洗数据生成标准化数据库。