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一种HPV精确分型的生物信息学分析方法及系统

摘要

本发明公开了一种HPV精确分型的生物信息学分型方法及系统,所述方法包括:接收高通量测序技术得到的测序片段,得到每个样本的reads序列;将所有样本的reads序列进行分组聚类,将聚类后的reads序列与HPV参考序列集进行比对和筛选,确定筛选后的reads序列的匹配结果;对确定HPV型别的reads序列采用LDA模型进行HPV分型,最终确认每个reads序列的HPV型别。

著录项

  • 公开/公告号CN111032885A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-04-17

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳华大基因股份有限公司;

    申请/专利号CN201780093704.X

  • 申请日2017-09-07

  • 分类号

  • 代理机构北京品源专利代理有限公司;

  • 代理人刘锴

  • 地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层

  • 入库时间 2023-12-17 10:16:29

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-05-12

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/70 申请日:20170907

    实质审查的生效

  • 2020-04-17

    公开

    公开

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