基于网络传播的蛋白质功能预测方法

摘要

本发明公开了一种基于网络传播的蛋白质功能预测方法，包括以下步骤：根据蛋白质相互作用网络拓扑结构建立无向加权网络，并将无向加权网络表征为无向图邻接矩阵M；根据蛋白质结构域信息和蛋白质复合物信息计算得到初始传播距离矩阵MI；根据无向图邻接矩阵M和初始传播距离矩阵MI，迭代地计算蛋白质间的网络传播距离以得到网络传播矩阵MP；根据网络传播矩阵MP逐步添加与测试蛋白质的邻接节点构成功能模块，多个功能模块构成候选功能列表；对候选功能列表中的候选功能评分、排序，选择排名靠前的若干项功能注释测试蛋白质。本发明改进了蛋白质功能预测方法研究中多源生物数据的融合方式，降低了相互作用网络中假阳性和假阴性对预测造成的负面影响，大大提高了蛋白质功能预测的准确率。