基于微生物组测序数据和机器学习算法的死亡时间推断方法

摘要

本发明公开了一种基于微生物组测序数据和机器学习算法的死亡时间推断方法，以提取自小鼠尸体的盲肠样本中的DNA为模板，针对微生物的16S rDNA设计引物进行PCR扩增，利用扩增产物建立基因文库并测序。对有效测序数据进行OTUs聚类和物种分类分析。基于物种的丰度分布情况去除相对丰度及组间方差变化小的物种分类，提取得到用来建立死亡时间推断模型的特征微生物种类，利用小鼠死亡后不同时间点的样本微生物丰度数据训练人工神经网络，得到可以准确预测死亡时间的数学模型。