一种联合分析单细胞scRNA-seq和scATAC-seq的流程方法

摘要

本发明公开了一种联合分析单细胞scRNA‑seq和scATAC‑seq的流程方法，包括scRNA‑seq分析、scATAC‑seq分析、scRNA‑seq和scATAC‑seq联合分析；本发明结构科学合理，使用安全方便，分析流程具有简便新颖性，先对scRNA‑seq数据做，基因差异分析和细胞聚类分析，再对scATAC‑seq数据做染色质可及性分析，转录因子的足迹分析和细胞聚类分析最后我们将两者数据通过coupledNMF联合分析，另外我们将coupledNMF原始要求输入五个文件简化为三个必须文件，简化操作流程，使之能够成为可操作运行的语言程序进行数据分析。