一种基于拓扑结构相似性的蛋白质结构模型质量评估方法

摘要

一种基于拓扑结构相似性的蛋白质结构模型质量评估方法，设计了一种新的蛋白质结构模型质量评估指标，根据目标蛋白和天然蛋白每对氨基酸在空间的距离信息判定两个结构的相似度；以两两二级结构在空间中形成的接触矩阵为单位一一比对相似度，对于局部结构的微小误差不敏感，而是从整体拓扑结构的相似性上打分。本发明将评估分数设定在[0,100]，分数越高表示蛋白质精度越高，消除了评估分数对蛋白质长度的依赖性。