基于结构频谱的蛋白质结构相似性分形比较

摘要

为了对蛋白质空间结构进行比较分析,本文采用二阶矩进行蛋白质质量主成份分析,以此构建蛋白质统一坐标系,在此统一坐标框架下,利用小波变换进行蛋白质三维空间结构频谱的建立,并进而对蛋白质三维结构频谱进行分形分析。实验结果与提供蛋白质结构比较的网站CE(http://cl.sdsc.edu/)所对应的数据相比较,结果表明,本方法快速有效,可对蛋白质空间结构进行多层次比较。