用于产生和使用最佳核苷酸流顺序的系统和方法

摘要

描述了用于产生尽可能降低序列数据中相位同步误差的累积的流顺序的方法的实施方案，其包括以下步骤： (a)产生包含k碱基长度的核苷酸种类的多个序列排序，其中所述序列排序定义将核苷酸种类引入边合成边测序反应环境的序列；(b)使用所述序列排序模拟从一个或更多个参考基因组获取序列数据，其中所述序列数据包含相位同步误差的累积；和(c)使用读取长度参数和延伸率参数选择所述序列排序中的一个或更多个。