Gleevec耐药的胃肠道间质瘤细胞系及其方法及裸鼠移植瘤模型

摘要

本发明公开了一种Gleevec耐药的胃肠道间质瘤细胞系及其方法及裸鼠移植瘤模型。由Gleevec耐药的胃肠道间质瘤（GIST）组织行原代细胞培养,建立了GIST-916耐药细胞系。GIST-916细胞系有以下特诊：倒置显微镜下呈互不重叠的单层，细胞生长呈成纤维细胞状，为长梭型。GIST-916对Gleevec具有较强的耐药性，在药物浓度在0.05-3μM之间时对细胞系的生长基本没有明显影响，3-5μM时受到轻度影响。GIST-916细胞系包含KIT基因exon11V559D原发突变和exon13V654A继发突变。GIST-916耐药移植瘤呈混合细胞型，部分区域可见横纹肌肉瘤分化，横纹肌肉瘤分化区域CD117阴性表达，但是Desmin弥漫阳性表达。本发明通过建立胃肠道间质瘤Gleevec耐药的细胞系作为平台来揭示GIST的耐药机制、逆转耐药以及开发和评价新的抗癌药物等。

说明书

技术领域

本发明属肿瘤生物学领域，涉及一种人胃肠道间质瘤耐药细胞系。根据中性蛋白酶消化原代培养法和/或组织块培养法并作改良，从1例Gleevec治疗失败的GIST患者中成功培养出1株Gleevec耐药的GIST细胞系，建立了Gleevec耐药的胃肠道间质瘤细胞系GIST-916。 

背景技术

胃肠道间质瘤（gastrointestinal stromal tumor，GIST）是位于胃肠道或腹腔内的表达KIT（CD117）蛋白的间叶源性肿瘤，绝大多数存在KIT基因的功能获得性突变，KIT基因突变在GIST发病过程中发挥关键的作用。Gleevec是一种口服的ATP的竞争性抑制剂，能竞争性地结合于KIT酪氨酸激酶功能区的ATP结合位点，阻断磷酸基团从ATP上转移到蛋白质底物（KIT，PDGFRA，ABL以及BCR-ABL融合蛋白）的酪氨酸残基，从而阻断了失控的信号传导通路，进而阻止细胞的持续增殖，并恢复细胞的正常凋亡程序，是靶向治疗胃肠道间质瘤的重要药物。然而一般在Gleevec平均治疗24个月后，将产生耐药，因此研究肿瘤耐药机制以及防止或逆转肿瘤耐药的发生对于提高靶向治疗效果十分重要。近年来，肿瘤耐药细胞系己成为重要的工具，大量研究利用它来揭示肿瘤细胞的耐药机制、研究肿瘤细胞的耐药性逆转、开发及评价新的抗癌方法等。建立肿瘤耐药细胞系具有重要应用价值。Gleevec是靶向治疗胃肠道间质瘤的最常用药物，因此有必要建立胃肠道间质瘤Gleevec耐药细胞系作为平台来揭示GIST的耐药机制、逆转耐药以及开发和评价新的抗癌药物等。 

发明内容

本发明的目的是提供一种胃肠道间质瘤Gleevec耐药细胞系及其建立方法，以及一种耐药GIST细胞裸鼠移植瘤模型。 

一种Gleevec耐药的胃肠道间质瘤细胞系，保藏名为Gleevec耐药的胃肠道间质瘤细胞系GIST-916，保藏于中国典型培养物保藏中心（武汉市武昌珞珈山武汉大学，邮编：430072），保藏编号:CCTCC NO：C2012171，保藏时间为2012年11月8日。 

本发明的耐药细胞系建立步骤如下:取部分Gleevec耐药的胃肠道间质瘤组织行原代细胞培养,建立了GIST-916耐药细胞系。用光学显微镜观察细胞形态， MTT法检测细胞耐药指数，行耐药细胞系的基因突变分析，建立耐药细胞系裸鼠移植瘤模型（成瘤情况和移植瘤生长曲线，组织学特征，免疫组织化学检测CD117、Desmin，移植瘤基因突变分析）。我们发现，GIST-916有以下特点：耐药的GIST原代细胞在倒置显微镜下呈互不重叠的单层，细胞生长呈成纤维细胞状，为长梭型;GIST-916对Gleevec具有较强的耐药性，在Gleevec药物浓度在0.05-3μM之间时对细胞系的生长基本没有明显影响，3-5μM时受到轻度影响，但在>10μM的高药物浓度下部分细胞的生长受到一定的抑制;GIST-916细胞系包含KIT基因exon11 1697T→A Val559Asp（V559D）原发突变和exon13 1982T→C Val654Ala（V654A）继发突变。耐药细胞系裸鼠移植瘤模型实验显示：随着接种时间的推移，GIST-916肿瘤的生长逐渐加速，肿瘤体积逐渐增大，细胞成瘤率为：GIST-916组60%（3/5）；GIST-916耐药移植瘤呈混合细胞型，部分区域可见横纹肌肉瘤分化，横纹肌肉瘤分化区域CD117阴性表达，但是Desmin弥漫阳性表达；而其他区域则CD117阳性表达，Desmin阴性表达；与细胞系抑制，GIST-916移植瘤同样包含KIT基因exon11 V559D原发突变和exon13 V654A继发突变。 

一种耐药GIST细胞裸鼠移植瘤模型，建立步骤如下： 

实验动物BALB/C/nu/nu品系裸鼠，无特殊病原体级,雌雄不限,鼠龄3～4周,体重19.0±2.0g；GIST-916细胞系接种5只裸鼠，均接种于背部皮下；其饲养和实验均在无特殊病原体环境中进行； 

耐药GIST细胞接种裸鼠：收集耐药GIST细胞系数目约1×10⁷接种于裸鼠背部皮下，次日记为接种第1天；每日观察荷瘤鼠饮食情况、精神状态、肿瘤大小与外观，用游标卡尺每10天测量一次裸鼠体重(g)和肿瘤的最长纵径(a)、与最长径垂直的最长横径(b),根据公式V(肿瘤体积)=(1/2)×ab²计算出肿瘤体积，绘制移植瘤生长曲线；经过中位时间约21天的生长静息期后，肿瘤生长速度逐渐加快，随着接种时间的推移，肿瘤的生长逐渐加速，肿瘤体积逐渐增大；从接种日期起，每10天计算移植瘤的体积描绘肿瘤生长曲线，GIST-916细胞成瘤率60%。 

本发明的有益效果 

为相关研究提供耐药肿瘤细胞模型：研究耐药肿瘤细胞形态学及生物学特点、研究肿瘤耐药机制、分析靶向治疗药物敏感性及筛选靶向治疗药物、开发肿瘤耐药逆转药物、研发更有效的肿瘤治疗方法等。 

附图说明

图1.倒置相差显微镜下Gleevec耐药的原代GIST-916细胞观察图; 

图2.GIST细胞系体外Gleevec药物敏感性试验； 

图3.GIST-916细胞耐药前KIT exon11 V559D突变； 

图4.GIST-916细胞耐药后KIT exon13 V654A； 

图5.Gleevec耐药的胃肠道间质瘤裸鼠移植瘤生长曲线； 

图6A.GIST-916横纹肌肉瘤分化区域HE染色； 

图6B.GIST-916横纹肌肉瘤分化区域CD117染色； 

图6C.GIST-916横纹肌肉瘤分化区域Desmin染色； 

图6D.GIST-916移植瘤CD117染色。 

具体实施方式

实施例1 

耐药细胞系建立步骤如下： 

取部分Gleevec耐药的胃肠道间质瘤组织行原代细胞培养，部分组织标本-80℃保存备用，其余标本固定、石蜡包埋后行HE和免疫组织化学检查。 

（1）组织块培养法 

取部分胃肠道间质瘤组织，仔细剔除外周可疑污染及坏死组织后，用0.01mol/L的PBS液冲洗3次，再用含500μg/ml庆大霉素、500μg/ml链霉素、500U/ml青霉素的无血清RPMI-1640冲洗5-6次，将组织剪成小块，均匀地铺在25cm2培养瓶中，置于37℃，5%CO2的孵箱中培养。1h后，每孔加入培养基0.5m1，继续培养。第二天再加入培养基lml。此后每3天换液一次。培养基为含15%FCS（胎牛血清）的RPMI-1640。 

（2）消化培养法 

取部分胃肠道间质瘤组织，仔细剔除外周可疑污染及坏死组织后，用0.01mol/L的PBS液冲洗3次，再用含500μg/ml庆大霉素、500μg/ml链霉素、500U/ml青霉素的无血清RPMI-1640冲洗5-6次，用眼科剪尽量剪碎组织至直径<1mm，用无血清RPMI-1640洗2次，加入2倍体积的1mg/ml的中性蛋白酶，37℃消化60min，收集单个及小块组织的瘤细胞，离心洗涤2次，接种于25c㎡培养瓶中，培养条件为含15%FCS的RPMI-1640。次日轻轻吸弃上清液，换新鲜培养液，此后每隔3天换液一次。 

耐药细胞培养成功后，及时冻存该浓度耐药细胞于液氮中。冻存液由20%小牛血清、5%DMSO、75%PMI 1640培养液组成，冻存过程应逐步降温，采取4℃30分钟→-20℃1小时→-70℃过夜→液氮的顺序进行。冻存细胞的复苏按以 下程序进行:在一个25c㎡的细胞培养瓶中加入至少10ml含15%胎牛血清的培养液;从液氮中取出装有细胞的冻存管，立即放入37℃水浴轻轻摇动使冻存物在1分钟内解冻，用酒精棉球擦拭冻存管外壁后拿入超净台;将解冻后的细胞悬液移入己加了培养液的培养瓶中，稍加摇动泪匀，拧松瓶盖，平放入二氧化碳培养箱中，在37℃、5%CO2、95%湿度条件下培养，约24小时细胞贴壁后换新鲜培养液3～5ml继续培养。 

实施例2 

对建立的GIST-916细胞株进行形态学观察、生物学特性鉴定、基因突变检测: 

1.倒置相差显微镜观察活细胞形态 

刚分离接种的耐药原代细胞大约12小时开始贴壁，48小时伸展开，72小时完全伸展开，原代培养的细胞第5天起开始增殖，约10-12天可传代。耐药的GIST原代细胞在倒置显微镜下呈互不重叠的单层，细胞生长呈成纤维细胞状，为长梭型（图1）。传代1-2代后，细胞生长加快，约5-7天传代一次。传代10-15代后原代细胞生长变慢，细胞倍增时间延长，细胞皱缩，后出现衰老、死亡。 

2.Gleevec耐药的人胃肠道间质瘤细胞系的体外药敏验证 

取对数生长期的GIST-916细胞，常规用0.25%胰蛋白酶消化各株细胞系，离心后弃上清，用培养基重悬细胞后，细胞计数板计数调整细胞浓度为3×10⁴/ml，以每孔100μl接种于96孔板，置于37℃，5%CO2的孵箱中培养。24h后，加入不同终浓度Gleevec（0.05-50μM），每个浓度设3个复孔并设对照孔。培养72h后，每孔加入5mg/ml的MTT20μl，37℃作用4h后弃上清，每孔加入二甲基亚砜（DMSO）150μl，振荡10min使结晶物混匀，在酶标仪570nm波长处读取吸光度值(OD)。以上步骤在不同时间重复3次，结果取均值。根据OD值计算细胞抑制率，计算公式:细胞抑制率=(1-实验组OD值/对照组OD值)×100%。根据每种药物不同浓度抑制率，利用SPSS17.0软件Regression中的Probit过程计算该药半数抑制浓度(IC50)，来判断细胞系对Gleevec的敏感/耐药性(图2)。GIST-916对Gleevec具有较强的耐药性，在Gleevec药物浓度在0.05-3μM之间时对这细胞系的生长基本没有明显影响，3-5μM时受到轻度影响，但在>10μM的高药物浓度下部分细胞的生长受到一定的抑制。 

3.Gleevec耐药的GIST细胞系的基因突变分析 

(1).基因组DNA抽提：按照真核基因组DNA抽提（酚/氯仿抽提、乙醇沉淀DNA法）的基本方法并作改良。细胞直接胰蛋白酶消化后收集，37℃开放干燥，加 500ul消化缓冲液及20μl蛋白酶K（20μg/μl,），定时混匀，过夜（55℃或更高），待管中液体变澄清后取出，置95℃煮沸10分钟灭活蛋白酶K；600μl酚氯仿抽提液，混匀45秒(手摇即可，否则容易造成DNA链断裂)，14000rpm离心5min，将上层液体移至新管中，重复抽提2次；600μl氯仿抽提液，混匀45秒(手摇即可，否则容易造成DNA链断裂)，14000rpm离心5min，再将上层液体移至新管中（注意：不要有杂质吸入）。6-7步次数可增加，视抽提后杂质存留情况而定。1/10体积3M乙酸钠（碱性溶液，溶解核酸）混匀，再加1ml-20℃无水乙醇（促进DNA沉积）至-70℃冰箱放置2小时以上；10000rpm以上转速离心，弃酒精，加1ml-20℃70%乙醇洗涤，离心（因为DNA容易溶解于水中，酒精洗涤时间不宜过长），弃酒精，37℃干燥（注意：不能哄得太干，无水即可）；加TE40-50μl重新悬浮DNA，紫外分光光度计测定浓度，并标化DNA浓度至1.5ng/ml，-20℃保存。测浓度前需静置1-2小时。 

(2).DNA浓度测定：将抽提好的DNA溶液，用蒸馏水稀释50倍，在波长260nm处用蒸馏水校正为零，然后读出280nm的A（蒸馏水）值。将各样本分别在260nm和280nm处检测，不同样本间，必须用蒸馏水冲洗比色杯。260nm测得是DNA的A值，280nm测得是蛋白质的A值。（A值一般在0.5以上比较稳定可靠，误差小）DNA浓度换算公式（单位ug/ml）=50×A260nm×稀释倍数。OD值=A260nm÷A280nm，OD值在1.6～1.8，DNA纯度高。 

(3).PCR引物的合成及其扩增条件 

1）运用软件Primer Premier5.0设计引物行PCR扩增，KIT基因第9，11，13，14，17号外显子和PDGFRA基因第l2，l8号外显子共6对引物均由上海生工公司合成（见表1）。扩增反应以双蒸水代替模板作为阴性对照。 

另外内参照基因β-actin的引物由浙江大学肿瘤研究所馈赠： 

引物序列：上游:tcctgtggcatccacgaaact 

下游:gaagcatttgcggtggacgat 

退火温度：58℃ 

产物长度：315bp 

表1KIT基因第9，11，13，14，17号外显子和PDGFRA基因第l2，14，l8号外显子扩增引物，退火温度和产物片段 

(4)PCR产物检测：取10μl PCR产物，进行1.5％琼脂糖凝胶电泳，DL 2000DNA Marker作为标志物。紫外投射仪上观察和照相。 

(5).测序分析：对PCR产物适当保存后，送上海生工生物有限公司进行DNA的纯化和测序分析(ABI3100测序仪)。有突变的病例再行反向DNA测序证实，并 与NCBI基因库KIT和PDGFRA基因序列进行比对。 

KIT基因exon9、11、13、14、17和PDGFRA基因exon12、14、18突变分析结果显示：GIST-916细胞系是KIT基因exon111697T→A Val559Asp（V559D）突变和exon13 1982T→C Val654Ala（V654A）继发突变；(图3,4)未发现PDGFRA基因突变。 

实施例3 

耐药GIST细胞裸鼠移植瘤模型的建立和鉴定 

1）成瘤情况和移植瘤生长曲线 

实验动物：BALB/C/nu/nu品系裸鼠由浙江中医药大学动物实验研究中心提供（许可证号：SYXK（浙）2008-0115）。无特殊病原体级,雌雄不拘,鼠龄3～4周,体重19.0±2.0g。GIST-916细胞系接种5只裸鼠，均接种于背部皮下。其饲养和实验均在无特殊病原体(specific pathogen free)环境中进行。 

耐药GIST细胞接种裸鼠：收集耐药GIST细胞系数目约1×107接种于裸鼠背部皮下，次日记为接种第1天。每日观察荷瘤鼠饮食情况、精神状态、肿瘤大小与外观，用游标卡尺每10天测量一次裸鼠体重(g)和肿瘤的最长纵径(a)、与最长径垂直的最长横径(b),根据公式V(肿瘤体积)=(1/2)×ab2计算出肿瘤体积，绘制移植瘤生长曲线。 

经过中位时间约21天的生长静息期后，肿瘤生长速度逐渐加快，随着接种时间的推移，肿瘤的生长逐渐加速，肿瘤体积逐渐增大。从接种日期起，每10天计算移植瘤的体积描绘肿瘤生长曲线（图5）。GIST-916细胞成瘤率60%（3/5）。 

2）组织学特征 

手术切除标本用4％甲醛固定，石蜡切片，行HE染色、光镜观察。光镜下GIST-916耐药移植瘤呈混合细胞型，但是部分区域形态上可见横纹肌肉瘤分化的现象。（图6A） 

3）免疫组织化学检测结果 

免疫组织化学染色：免疫组织化学采用EnVision二步法，切片厚4μm，二甲苯脱蜡、梯度酒精水化，置于3%H₂O₂内5min，灭活内源性过氧化物酶。置于0.01M枸橼酸缓冲溶液中，加热修复抗原20min后，自然冷却20min。滴加一抗，室温孵育4h，PBS冲洗，2min×3次；滴加二抗，37℃温箱内孵育30min，PBS冲洗2min×3次；DAB显色，蒸馏水冲洗、苏木素复染，梯度酒精脱水，二甲苯透明，中性树脂封固。Desmin、CD117(多抗,稀释度1∶100)为丹麦DAKO公司产品。用PBS代替一抗作空白对照。 

GIST-916耐药移植瘤呈混合细胞型，部分区域可见横纹肌肉瘤分化，横纹肌肉瘤分化区域CD117阴性表达（图6B），但是Desmin弥漫阳性表达（图6C）；而其他区域则CD117阳性表达（图6D），Desmin阴性表达。 

4）基因突变分析 

GIST组织的基因组DNA抽提，按照真核基因组DNA抽提（酚/氯仿抽提、乙醇沉淀DNA法）的基本方法并作改良，在上述细胞DNA提取步骤前增加：-80℃取出备用的GIST标本；液氮中陶瓷研钵研磨，组织呈粉状时转移到预先称重的1.5ml Eppendorf管中，称重，得组织50-100mg。组织DNA含量测定、PCR引物条件、测序方法同细胞系DNA。 

KIT基因exon9、11、13、14、17和PDGFRA基因exon12、18突变分析结果显示，移植瘤的突变类型与接种前细胞系突变类型相一致，GIST-916移植瘤KIT基因exon11 1697T→A Val559Asp突变和exon13 1982T→C Val654Ala突变。未发现PDGFRA基因突变。