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基于序列相似性与频谱3-周期性的基因识别方法

摘要

本发明公开一种基于序列相似性与频谱3-周期性的基因识别方法,属于生物信息学中的基因识别领域。所述基因识别方法利用核苷酸频率特征矩阵来描述DNA序列;对不同序列通过计算核苷酸频率特征矩阵相似度来确定DNA序列的相似度,并根据相似度选定信噪比阈值;通过计算序列核苷酸频谱3-周期性强度以及序列中每个核苷酸位置处的斜率来区分外显子与内含子,并通过修正处理最终确定外显子段。本发明解决了对于给定DNA序列,根据频谱3-周期性基因识别算法中信噪比阈值过于单一,阈值确定过程缺乏考虑基因类别的问题。

著录项

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2016-04-06

    授权

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  • 2013-08-21

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/22 申请日:20130403

    实质审查的生效

  • 2013-07-24

    公开

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