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法律状态信息
法律状态
2017-05-10
未缴年费专利权终止 IPC(主分类):C07K14/415 授权公告日:20140611 终止日期:20160328 申请日:20130328
专利权的终止
2014-06-11
授权
授权
2014-03-19
著录事项变更 IPC(主分类):C07K14/415 变更前: 变更后: 申请日:20130328
著录事项变更
2014-03-19
专利申请权的转移 IPC(主分类):C07K14/415 变更前: 变更后: 登记生效日:20140226 申请日:20130328
专利申请权、专利权的转移
2013-07-24
实质审查的生效 IPC(主分类):C07K14/415 申请日:20130328
实质审查的生效
2013-06-19
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(一)技术领域
本发明涉及一种来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1及其编码基 因、载体、工程菌与应用方法。
(二)背景技术
牡丹(Paeonia suffruticosa)是原产中国的著名花灌木,更是具有深 厚文化内涵的中国传统名花。近年民间有关“国花”的网络评比中,牡丹 屡夺“花魁”之美誉。随着我国园林花卉产业的发展,牡丹在城乡绿化和 药材种植中的应用大幅提升,然而,千百年的人工驯化使得牡丹抗逆能力 较差,其研究、应用集中分布于黄河流域,广袤的国土依然有大片的牡丹 种植“禁区”,这大大限制了“花魁”在花卉产业中的发展。
牡丹在长江以南地区难以广泛种植的根本原因是其对环境的适应能 力比较差,提高其抗逆性能是使牡丹花开全国的主要任务。DREB类转录 因子是一类普遍存在于高等植物体内的抗逆转录因子,该类基因的表达可 以启动一系列抗逆反应的发生,从而大大提高植株本身的抗逆性能。克隆 并研究该类转录因子,将利用价值高的成员导入到植物体内,是通过转基 因手段定向培育高抗植物的有效手段。本发明就是利用同源克隆法,首先 获取牡丹PsDREB1的部分片段,然后通过RACE技术获取全部编码区段, 进而通过转基因手段发现其具有显著提高植物抗性的例证。
(三)发明内容
本发明目的是提供一种牡丹DREB类转录因子,通过超量表达证明 其具有提高植物抗旱、抗高盐的能力。
本发明采用的技术方案是:
本发明提供一种来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1,所述抗逆转 录因子PsDREB1具有SEQ ID NO.1所示氨基酸序列90%以上同源性, 优选所述抗逆转录因子PsDREB1的氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示。由 于氨基酸序列的特殊性,任何含有SEQ ID No.1所示氨基酸序列的肽蛋 白的片段或其变体,如其保守性变体、生物活性片段或衍生物,只要该肽 蛋白的片段或肽蛋白变体与前述氨基酸序列同源性在90%以上,均属于 本发明保护范围之列。具体的所述改变可包括氨基酸序列中氨基酸的缺 失、插入或替换;其中,对于变体的保守性改变,所替换的氨基酸具有与 原氨基酸相似的结构或化学性质,如用亮氨酸替换异亮氨酸,变体也可具 有非保守性改变,如用色氨酸替换甘氨酸。
本发明还涉及所述来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1的编码基 因,所述抗逆转录因子PsDREB1的编码基因具有SEQ ID NO.2所示核苷 酸序列90%以上同源性,优选所述抗逆转录因子PsDREB1的编码基因的 核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示。由于核苷酸序列的特殊性,任何SEQ ID NO:2所示多核苷酸的变体,只要其与该多核苷酸具有90%以上同源 性,均属于本发明保护范围之列。所述多核苷酸的变体是指一种具有一个 或多个核苷酸改变的多核苷酸序列。此多核苷酸的变体可以使生的变位变 异体或非生的变异体,包括取代变异体、缺失变异体和插入变异体。如本 领域所知的,等位变异体是一个多核苷酸的替换形式,它可能是一个多核 苷酸的取代、缺失或插入,但不会从实质上改变其编码的肽蛋白的功能。
本发明涉及含有所述抗逆转录因子PsDREB1的编码基因的载体。
本发明还涉及一种含有所述抗逆转录因子PsDREB1的编码基因载体 的重组基因工程菌。所述重组基因工程菌的构建方法为:构建含有抗逆转 录因子PsDREB1的编码基因的重组载体,将所述重组载体转化至农杆菌 菌株EHA105中,获得的重组基因工程菌进行诱导培养,培养液分离纯 化获得含有抗逆转录因子PsDREB1的编码基因的重组基因工程菌的菌体 细胞。
本发明还提供所述抗逆转录因子PsDREB1的编码基因在培育抗旱、 抗高盐植物中的应用。如本发明所述的转基因植株(PsDREB1)的较野 生型烟草生长表现出显著的耐旱特性。并且转基因烟草显示抗高盐胁迫能 力明显高于野生型材料。
本发明的要点在于提供了SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列和SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,在已知该氨基酸序列和核苷酸序列的情况下, 该氨基酸序列和核苷酸序列的获得,以及相关载体、宿主细胞的获得,对 于本领域技术人员来说均是显而易见的。
本发明所提供的抗逆转录因子PsDREB1是从牡丹中获得的,它属于 具有显著抗逆功能的众多DREB转录因子家族中的一员。该转录因子同 其他物种的DREB基因一样,不含有内含子,方便采用基因组DNA为模 板克隆获得。通过构建超量表达载体并异源转化烟草,发现该转录因子具 有明显的提高烟草抗旱和抗高盐的能力。
与现有技术相比,本发明的有益效果主要体现在:本发明首次从牡丹 中克隆DREB类抗逆转录因子,即抗逆转录因子PsDREB1;本发明通过 与拟南芥6类DREB转录因子同源比对,发现其属于第6类DREB;通 过转基因实验,发现该基因具有明显的提高植物抗旱、抗高盐的能力,证 明其是一个非常有应用价值的转录因子。
(四)附图说明
图1来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1与其他物种同源基因的多 序列比对结果图;
图2超量表达来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1导致转基因烟草 抗旱能力提升照片;
图3超量表达来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1导致转基因烟草 抗高盐能力提升照片。
图4来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1的核苷酸序列(SEQ ID NO.2所示),氨基酸序列(SEQ ID NO.1所示)。
(五)具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围 并不仅限于此:
实施例1来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1的获得
于2010年5月取6年生牡丹品种“乌龙捧盛”的幼嫩叶片为材料,采用 普通CTAB法(植物基因工程,王关林,2002版)提取总DNA,以总DNA 为模板,用兼并引物对:GPF-AARCCRTNACHGATDAARMAA, GPR-CCANGC TRSRTCNGCRAARTT对其进行PCR扩增。反应程序为 95℃1min,94℃50s,56℃1min,72℃1min,36个循环,72℃5min,所用 试剂(LATaq酶)均购自大连宝生物公司,扩增体系:LAtaq酶(5U/μl) 0.5μl,10×LAtaq bufferⅡ5μl,Dtnp mixture8μl,template1μl,引物11μl, 引物21μl,灭菌蒸馏水32.5μl。经过PCR扩增获得226bp的中间片段。
以上述PCR扩增获得226bp的中间片段为参考,设计3’RACE和 5’RACE引物,以获取中间序列两端的序列。具体是,3’RACE用到的引物 对:3’f-GAGAAGTCCGTGCGCCTGG,3’r-CT ACTTCA TTACCCCCTTCT,扩增程序为95℃1min,94℃50s,68℃1min, 72℃1.5min,36个循环,72℃5min,扩增体系:LAtaq酶(5U/μl)0.5μl, 10×LAtaq bufferⅡ5μl,Dtnp mixture8μl,template1μl,引物11μl,引物 21μl,灭菌蒸馏水32.5μl。通过PCR扩增获得中间序列及下游片段。
5’RACE用到的引物对:5’f-TGCATCTGGC TGTCGACTG, 5’r-CACA TTGCAGGTGACTTTG,扩增程序为95℃1min,94℃50s, 66℃1min,72℃1min,36个循环,72℃5min,扩增体系:LAtaq酶(5U/μl) 0.5μl,10×LAtaq bufferⅡ5μl,Dtnp mixture8μl,template1μl,引物11μl, 引物21μl,灭菌蒸馏水32.5μl。经过PCR扩增获得中间序列及上游片段。
将PsDREB1基因的上游片段和下游片段进行序列拼接,获得了完整 编码框(CDS),经过http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html网站分析, 该编码框有363个氨基酸,具有明显的起始和终止密码子,说明该基因的 完整性。分析推测的氨基酸序列,该基因含有一个保守的AP2结构域,共 计59个氨基酸残基,分离得到的转录因子在其AP2保守区域中其第14和19 位氨基酸分别是缬氨酸(V14)和亮氨酸(L19),与所有分离得到的其他 物种的DREB类转录因子相符,也再次证明该转录因子为DREB类转录因 子。虽然该基因未发现有明显的核定位信号,但是作为转录因子,一般发 挥功能都是在细胞核内,具体的定位信息有待实验进一步验证。
因此,将获得的编码框(CDS)命名为抗逆转录因子PsDREB1。通 过公共平台NCBI网站中ORFinder软件的应用,获得了抗逆转录因子
PsDREB1的编码框区域,并得到了预测的氨基酸组成信息。该基因编码 区的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示,氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示。
实施例2含抗逆转录因子PsDREB1编码基因的重组基因工程菌的制备 利用特异引物对:sppf--ga(GAGCTC)atgtggctcggcacatttg(含sac1酶切位 点),sppr—gc(gtcgac)ttagatagcctcttttactcg(含sal1酶切位点),以实施例 1中获得的高质量总DNA(即氨基酸序列为SEQ ID NO.1所示的抗逆转 录因子PsDREB1)为模板进行PCR反应,反应程序为:95℃1min,94℃50s, 66℃1min,72℃1.5min,36个循环,72℃5min,反应体系:LAtaq酶(5U/μl) 0.5μl,10×LAtaq bufferⅡ5μl,Dtnp mixture8μl,template1μl,引物11μl, 引物21μl,灭菌蒸馏水32.5μl。将获得的PCR产物回收后进行sac1、sal1 双酶切,酶切体系按照TAKARA公司产品说明书进行。酶切后的基因片 段与同样酶切回收的表达载体Pcambia2300(M)中,测序验证,测序结 果与原始数据一致。然后将阳性质粒电击导入农杆菌菌株EHA105中, 获得含抗逆转录因子PsDREB1编码基因的重组基因工程菌,即含有超量 表达载体的农杆菌菌株EHA105。
实施例3含抗逆转录因子PsDREB1编码基因在制备抗逆植物中的应用 用实施例2制备的含有超量表达载体的农杆菌菌株EHA105侵染普通烟草 无菌苗叶片,采用通用叶盘法转化(材料与方法严格参照Horsch RB,Fry JE,Hoffman NL,Eicholtz D,Rogers SG,Fraley RT(1985)A simple and general method for transferring genes into plants.Science227:1229–1231.)。 获得含有抗逆转录因子PsDREB1编码基因的抗性烟草植株。经过后代分 离筛选和southern杂交确定单克隆株系后自交纯化,获得T3代株系,用于 后续试验分析。
耐旱试验始自2012年6月5号,T2代种子播种后与野生型(WT) 对照同时同条件培养,30天后开始耐旱试验。处理第3天和第6天分别 拍照观察,耐旱表现如图2所示。结果显示野生型烟草在干旱处理第3 天后开始出现萎蔫现象,第6天萎蔫明显,较转基因植株(PsDREB1) 的生长表现明显衰弱,而转基因植株则表现出较为显著的耐旱特性。
在耐高盐胁迫中,材料准备同耐旱试验。使用300mmol/L浓度的氯 化钠水溶液浸泡同样条件的穴盘苗,1小时后取出计时。观察处理后1天、 3天、6天的抗逆表现。结果发现,野生型烟草在高盐处理1天后,与转 基因烟草一样表现出较为明显的萎蔫现象,但是在第3天和第6天,野生 型烟草的萎蔫程度显著大于转基因烟草,叶片干枯黄化数量明显多于转基 因烟草,显示转基因烟草抗高盐胁迫能力明显高于野生型材料,如图3 所示。
SEQUENCE LISTING
<110> 浙江省萧山棉麻研究所
<120> 来源于牡丹的抗逆转录因子PsDREB1及其编码基因与应用
<130>
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 363
<212> PRT
<213> Paeonia suffruticosa
<400> 1
Met Thr Thr Ala Ile Asp Ile Tyr Asn Ser Ala Ser Val Phe Ser Asp
1 5 10 15
Pro Glu Glu Leu Met Lys Ala Leu Glu Pro Phe Met Lys Gly Ala Ser
20 25 30
Ser Ser Phe Ser Leu Pro Ser Leu Ser Ser Phe Ser Leu Ser Pro Ser
35 40 45
Thr Ser Leu Pro Pro Ser His Phe Ser Pro Ile Ser Ser Gln Pro Asn
50 55 60
Leu Tyr Ser Asp Phe Cys Ser Pro Ser Thr Thr His Met Phe Ser Gln
65 70 75 80
Gly Cys Ser Ser Phe Asp Gln Met Gly Phe Glu Gln Ser Gly Ser Leu
85 90 95
Gly Leu Ser His Leu Thr Pro Ser Gln Ile Leu Gln Ile Gln Ala Gln
100 105 110
Met His Ile Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Gln Ile
115 120 125
Ala Ala Met Ala Val Ala Ser Ile Gln Asn Arg Arg Leu Asn Gln Trp
130 135 140
Gln His Gln Thr Gln Asn Ser Leu Ser Pro Lys Thr Val Pro Met Lys
145 150 155 160
His Ala Gly Thr Pro Pro Lys Pro Thr Lys Leu Tyr Arg Gly Val Arg
165 170 175
Gln Arg His Trp Gly Lys Trp Val Ala Glu Ile Arg Leu Pro Lys Asn
180 185 190
Arg Thr Arg Leu Trp Leu Gly Thr Phe Asp Thr Ala Glu Glu Ala Ala
195 200 205
Leu Ala Tyr Asp Arg Ala Ala Tyr Lys Leu Arg Gly Asp Tyr Ala Arg
210 215 220
Leu Asn Phe Pro His Leu Arg Ser His Ile Ala Gly Asp Phe Gly Gly
225 230 235 240
Asp Tyr Lys Pro Leu His Ser Ser Val Asp Ala Lys Leu Gln Ala Ile
245 250 255
Cys Gln Ser Met Ala Ile Ser Gln Lys Gln Gly Ser Ser Glu Arg Pro
260 265 270
Gly Phe Val Ser Asp Thr Lys Ser Ile Ala Pro Leu Val Pro Ser Gln
275 280 285
Ala Lys Met Val Ser Glu Val Glu Leu Gln Arg Pro Lys Leu Glu Asp
290 295 300
Cys Lys Val Glu Pro Glu Thr Phe Ser Ser Pro Ser Val Ser Asp Glu
305 310 315 320
Ser Ala Gly Ser Ser Pro Gln Ser Asp Ile Thr Phe Phe Asp Phe Thr
325 330 335
Glu Ser Ser Gln Leu Gly Asp Glu Cys Asp Asn Leu Met Leu Gln Lys
340 345 350
Phe Pro Ser Val Glu Ile Asp Trp Glu Ala Ile
355 360
<210> 2
<211> 1092
<212> DNA
<213> Paeonia suffruticosa
<400> 2
atgtggctcg gcacatttga tacggctgaa gcatcagttt tctcagatcc cgaagagctc 60
atgaaagcac ttgaaccttt tatgaagggt gcttcttcat ccttttccct gccttctctt 120
tcttcttttt cactatctcc ctctacttca ttaccccctt ctcatttctc tcctatctct 180
tctcagccca acttgtattc tgatttttgc tcaccatcga ccacccatat gttttctcaa 240
gggtgttcga gctttgacca aatgggtttt gagcaatcag gttcattagg gctaagccac 300
cttaccccat ctcagatctt gcaaattcaa gcccaaatgc acatccaaca acaacaacag 360
cagcagcaac agcaacagca gatagctgcc atggctgtag catcaattca gaaccggagg 420
ctaaaccaat ggcaacacca aacccagaat tctctcagcc ccaaaactgt tcctatgaag 480
catgctggaa ctcctccaaa gcccacaaag ctttacagag gagtgaggca gaggcattgg 540
ggaaaatggg ttgcagagat cagactccca aagaaccgta ctcgtctttg gctcggcaca 600
tttgatacgg ctgaagaagc agccctggct tatgacaggg ctgcttataa gcttagagga 660
gactatgcca gattgaactt cccacacctc cgatctcaca ttgcaggtga ctttggcggc 720
gattacaagc ctcttcattc ctcagtcgac gccaagcttc aagcgatttg ccagagcatg 780
gctatttcgc agaaacaggg gagttcggag aggcctggtt ttgtatctga taccaagtca 840
attgcgccac ttgttccttc tcaggcgaag atggtgtcgg aagttgaatt gcagcgtcca 900
aaattagagg attgtaaggt ggagccggag acattctcgt cgccgtctgt atctgacgaa 960
tcggcaggtt cttcgcctca atcggatatt acgttctttg atttcacgga gtcgtcgcag 1020
ttgggggatg agtgtgataa cttaatgctg cagaagtttc aggatattga gcgagtaaaa 1080
gaggctatct aa 1092
机译: 来源于细菌冷休克蛋白的蛋白及其在赋予植物抗逆性方面的应用。
机译: ATHG1蛋白质延缓衰老并为植物提供基因编码基因的抗逆性及其应用。
机译: NAC091D转录因子蛋白及其编码基因在抑制种子萌发中的应用