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一种蛋白质相互作用位点识别方法

摘要

本发明公开了一种蛋白质相互作用位点识别方法,属于生物信息学分析领域。本发明的方法为:先采集蛋白质链数据并对蛋白质链数据进行预处理,再将预处理后的蛋白质链数据分为界面残基和非界面残基;而后从数据库中提取特征,并将提取的特征进行融合得到数据集,再对数据集的不平衡性进行处理,然后将处理后的数据集分为训练集和测试集,再利用训练集训练XGBoost模型,最后利用XGBoost模型得到蛋白质相互作用位点。本发明目的在于克服现有技术中,对蛋白质相互作用位点进行预测时持有不同程度的“假阳性”、“假阴性”特征,使得结果分析比较困难的不足,本发明可以克服以上不足,且可以提高蛋白质相互作用位点的识别精度。

著录项

  • 公开/公告号CN110265085A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-09-20

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 安徽工业大学;

    申请/专利号CN201910686641.X

  • 申请日2019-07-29

  • 分类号G16B20/30(20190101);G16B40/00(20190101);

  • 代理机构34134 安徽知问律师事务所;

  • 代理人王亚军

  • 地址 243002 安徽省马鞍山市湖东路59号

  • 入库时间 2024-02-19 14:44:26

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-10-22

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/30 申请日:20190729

    实质审查的生效

  • 2019-09-20

    公开

    公开

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