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使用参考序列表示和处理生物信息数据的方法和系统

摘要

当基因组测序机产生的基因组序列数据在一个或更多个参考序列上进行比对时,表示和处理该基因组序列数据的方法和装置。通过将读序相对于已有的或构造的参考序列进行比对来编码该读序。在比对之后,编码处理包括将读序分类成数据类,接着就描述符层的多重性对各个数据类进行编码。使用特定的源模型和熵编码器对用于表示各个数据类的描述符的子集进行编码。

著录项

  • 公开/公告号CN110121577A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-08-13

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 基因组系统公司;

    申请/专利号CN201780063014.X

  • 申请日2017-07-11

  • 分类号C40B50/00(20060101);G16B45/00(20190101);G16B30/10(20190101);

  • 代理机构11127 北京三友知识产权代理有限公司;

  • 代理人黄纶伟;李辉

  • 地址 瑞士洛桑市

  • 入库时间 2024-02-19 12:27:16

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-11-01

    实质审查的生效 IPC(主分类):C40B50/00 申请日:20170711

    实质审查的生效

  • 2019-08-13

    公开

    公开

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