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一种用于检测肿瘤患者血液ctDNA中的超低频突变位点的生物信息方法

摘要

本发明公开了一种用于检测肿瘤患者血液ctDNA的超低频突变位点的生物信息方法,包括以下步骤:提取cfDNA,加入随机序列标签,建立文库并测序;对测序数据进行拆分、质控、过滤和整合;从拆分后的数据中提取随机标签序列,把双端的随机序列整合在一起,并对这些序列进行校正;把整合的序列与人类参考基因组进行比对序列比对,根据随机序列标签纠正测序数据;获取可信的测序数据集合,测序基因突变检测。本发明适用于所有具有随机序列标签的ctDNA双端测序数据,这种通过处理此数据来检测ctDNA超低频基因突变的方法具有重大的应用推广价值。

著录项

  • 公开/公告号CN109762881A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-05-17

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中山拓普基因科技有限公司;

    申请/专利号CN201910096321.9

  • 发明设计人 邝健宇;周天亮文;

    申请日2019-01-31

  • 分类号

  • 代理机构广州三环专利商标代理有限公司;

  • 代理人朱本利

  • 地址 528437 广东省中山市火炬开发区神农路6号A3栋5楼2卡

  • 入库时间 2024-02-19 09:26:47

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-10-11

    著录事项变更 IPC(主分类):C12Q1/6869 变更前: 变更后: 申请日:20190131

    著录事项变更

  • 2019-06-11

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6869 申请日:20190131

    实质审查的生效

  • 2019-05-17

    公开

    公开

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