一种基于局部结构比对的蛋白质构象空间优化方法

摘要

一种基于局部结构比对的蛋白质构象空间优化方法，在进化算法的基本框架下，采用基于局部结构比对的搜索策略，随机选择一个片段插入窗口，通过两个独立的结构指标将构象中原有的片段信息与片段库中的片段信息进行比对，并根据这两个结构比对指标选出一个潜在片段进行结构替换；最后，根据Monte Carlo机制指导种群的更新，选出潜在的构象进入下一代种群。本发明提出一种预测精度高、计算代价低的基于局部结构比对的蛋白质构象空间优化方法。