黄鲫高密度SNP标记筛选方法和应用

摘要

本发明公开了一种黄鲫高密度SNP标记筛选方法，包括提取基因组DNA、RAD文库构建与高通量测序、原始序列数据过滤、SNP信息位点检测与筛选；在提取基因组DNA过程中加入环状DNA和甲壳质，能有效提高SNP标记筛选准确度；在PCR扩增体系过程中加入甲壳质流体，能够提高PCR扩增的反应敏感度从而有助于获得完整的高密度SNP位点；用该方法获得的黄鲫高密度SNP位点可应用于对黄鲫种群进行遗传多样性水平、种群遗传结构等分析。有益效果：本发明获取黄鲫高密度SNP标记位点的方法具有简单、高效、SNP标记筛选准确度高、重复性好、成本低等优点。