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A New Graph Theoretical Method for Analyzing DNA Sequences Based on Genetic Codes

机译:基于遗传密码的图论分析DNA序列的新方法

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摘要

In this work, we use some concepts of graph theory to propose an alignment-free method for DNA sequence similarity analysis based on genetic codes. Our approach gives an effective and unique representation for each DNA sequences. In addition, according to our method, we give a numerical characterization of DNA sequences. This characterization facilitates quantitative comparisons of similarities/dissimilarities analysis of DNA sequences based on codons.
机译:在这项工作中,我们使用图论的一些概念为基于遗传密码的DNA序列相似性分析提出一种免比对方法。我们的方法为每个DNA序列提供了有效且独特的表示形式。另外,根据我们的方法,我们给出了DNA序列的数字表征。该表征有助于基于密码子的DNA序列的相似性/不相似性分析的定量比较。

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