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methylC Track: visual integration of single-base resolution DNA methylation data on the WashU EpiGenome Browser

机译:methylC Track:在WashU EpiGenome浏览器上视觉整合单碱基分辨率DNA甲基化数据

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摘要

We present methylC track, an efficient mechanism for visualizing single-base resolution DNA methylation data on a genome browser. The methylC track dynamically integrates the level of methylation, the position and context of the methylated cytosine (i.e. CG, CHG and CHH), strand and confidence level (e.g. read coverage depth in the case of whole-genome bisulfite sequencing data). Investigators can access and integrate these information visually at specific locus or at the genome-wide level on the WashU EpiGenome Browser in the context of other rich epigenomic datasets
机译:我们提出了methylC track,这是一种在基因组浏览器上可视化单碱基分辨率DNA甲基化数据的有效机制。甲基C轨迹可动态整合甲基化水平,甲基化胞嘧啶的位置和背景(即CG,CHG和CHH),链和置信度水平(例如,在全基因组亚硫酸氢盐测序数据的情况下读取覆盖深度)。研究人员可以在其他丰富的表观基因组数据集中,在WashU EpiGenome浏览器上的特定位置或全基因组水平上以可视方式访问和整合这些信息。

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