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The 3DGD: a database of genome 3D structure

机译:3DGD:基因组3D结构数据库

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摘要

The studies of chromatin 3D structure help us to understand its formation and function. Techniques combining chromosome conformation capture and next generation sequencing can capture chromatin structure information and has been applied to several different species and cell lines. We built 3DGD (3D Genome Database), a database that currently collected Hi-C data on four species, for easy accessing and visualization of chromatin 3D structure data. With the integration of other omics data such as genome-wide protein-DNA-binding data, this data source would be useful for researchers interested in chromatin structure and its biological functions.
机译:对染色质3D结构的研究有助于我们了解其形成和功能。结合了染色体构象捕获和下一代测序的技术可以捕获染色质结构信息,并已应用于几种不同的物种和细胞系。我们建立了3DGD(3D基因组数据库),该数据库当前收集了四个物种的Hi-C数据,以便于访问和可视化染色质3D结构数据。通过整合其他组学数据,例如全基因组蛋白质-DNA结合数据,该数据源将对对染色质结构及其生物学功能感兴趣的研究人员有用。

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