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【24h】

Etude de l'epidemiologic moleculaire et de la phylogenie des souches du virus de l'hepatite C sous-type 1b en Tunisie

机译:突尼斯丙型肝炎病毒1b亚型毒株的分子流行病学和系统发育研究

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摘要

Le virus de l'hepatite C (VHC) est un virus ubiquitaire, responsable d'infections chroniques pouvant aboutir a un hepatocarcinome. La prevalence d'infection par ce virus en Tunisie est de l'ordre de 0,7 %. Un taux relative ment plus eleve a ete confirme dans la region du Nord-Ouest, notamment a Beja. Les etudes de genotypage des souches virales tunisiennes montrent une large predominance du sous-type lb. Une etude anterieure a suggere la cir culation d'un 《 variant 》 specifique du sous-type lb, qui serait predominant dans les regions urbaines du gouvernorat de Beja. L'objectif du present tra vail est de confirmer cette hypothese, en analysant un nombre important de souches lb, provenant d'autres regions de la Tunisie et de les comparer avec celles circulant au Nord-Ouest et avec d'autres provenant d'autres regions du monde. Nous avons effectue une analyse phylogenetique dans deux regions distinctes du genome viral : la NS5B et la El. Les resultats montrent que plus de la moitie des souches tunisiennes etudiees se regroupent ensemble formant un cluster de sequences presque exclusivement tunisien. Ce cluster phylogenetique comprend la grande majorite des souches de Beja. Ce resultat a ete observe apres les analyses en NS5B et en El du genome viral. Ces constatations confirment la circulation d'un variant particulier de souches VHC lb en Tunisie, plus particu lierement au Nord-Ouest où il serait lie a une source commune de transmission du virus dans la region comme cela a ete evoque anterieurement.
机译:丙型肝炎病毒(HCV)是一种普遍存在的病毒,可引起可能导致肝癌的慢性感染。在突尼斯,这种病毒的感染率约为0.7%。在西北地区,特别是在贝贾,已确认相对较高的发病率。突尼斯病毒株的基因分型研究显示,lb亚型占很大优势。一项较早的研究提出了一种特定的lb亚型变异的流行,这种变异在贝雅省的城市地区占主导地位。这项工作的目的是通过分析来自突尼斯其他地区的大量菌株lb,并将其与西北地区流通的以及与突尼斯其他地区的其他菌株进行比较,来确认这一假设。世界各地。我们在病毒基因组的两个不同区域进行了系统发育分析:NS5B和El。结果表明,研究的突尼斯菌株中有一半以上聚在一起,形成几乎唯一的突尼斯序列簇。该系统发育簇包括绝大部分的Beja株。在NS5B和病毒基因组的E1中分析后观察到该结果。这些发现证实了在突尼斯,特别是西北地区,HCV毒株的一种特殊变体的流行,如前所述,它将与该地区病毒的常见传播源相联系。

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