ГЕНОМНЫЕ ОСТРОВА ШТАММА Sinorhizobium meliloti Rml021 -АЗОТФИКСИРУЮЩЕГО СИМБИОНТА ЛЮЦЕРНЫ

摘要

Проведен анализ in silico открытых рамок считывания геномных островов штамма Sinorhizobium те-liloti Rml021, типичного представителя почвенных бактерий, формирующих азотфиксирующий симбиоз с бобовыми растениями-хозяевами из группы перекрестной инокуляции люцерны. Показано, что геномные острова имеют мозаичную структуру, в которой чередуются блоки функционально-значащих генов, IS-элементов и генов некодирующих РНК. Также в них имеются элементы систем T4SS и Т4СР и отсутствуют системы конъюгативной мобилизации. Сделано заключение, что два из трех островов могут являться вариантами редуцированных интегративных конъюгатив-ных элементов, а третий — редуцированным интегрированным конъюгативным транспозоном. Сайтспецифический характер встраивания островов происходит по последовательности длиной 15—31 пн (в зависимости от острова), локализованной на З'-конце генатРНК, которая при этом смещается вправо, а оставшаяся часть гена тРНК достраивается аналогичной последовательностью, которая имеется в составе острова. Выдвинуто предположение о существовании видоспецифичных "горячих" точек инсерции для геномных островов клубеньковых бактерий.