Fluidigm C1~(?)システムを用いたシングルセル解析?マルチ才ミクス解析を可能にする唯一のシングルセル自動調製システム?

摘要

近年,再生医療研究,癌研究など,不均一な細胞集団を扱う研究分野においては,シングルセル解析が不可欠な手法となっている。シングルセル解析,特にqPCRやRNA-seqにょるシングルセル遺伝子発現解析は,ここ数年で広く普及し,急速な論文数の伸びを示している。2016年にはシングルセル解析にょってヒ卜の全セルタィプを明らかにするための"Human Cell Atlas Project (https://www.humancellatlas.org/)がスタ一卜し,解析技術の進展と情報基盤の整備が急速に進むものと予測されている。この大規模プロジェクトと並行して,各研究分野ではょリ詳細なシングルセル解析の需要が高まリ,シングルセルのマルチオミクス解析を高感度かつ高精度で行える技術の開発が必要とされている。Fluidigm社は,2013年からシングルセル解析に特化したサンプル調整システムとして,C1~(?) Single- Cell Auto-Prepシステム(以下,C1システム)をリリースし,すでに世界で600台以上(国内で60台以上)の販売実績を有している。本システムはマィクロフル一ディクス技術を利用してバルクの細胞サンプルから96または800個のシングルセルを物理的に単離し(顕微鏡での確認が可能),その後の細胞溶解,逆転写,前増幅などの反応工程を,アプリヶーションに合わせて自動で行うことができる装置である。増幅?回収されたcDNAまたはgDNAサンプルは,Fluidigm社のBiomark~(?) HDシステムを用いたシングルセルqPCR解析やscGEM解析(遺伝子発現,DNAのメチル化, DNAの点突然変異解析を同一細胞で同時に行う解析手法),次世代シーヶンサーを用いた卜ランスクリプト一ム解析,ゲノム解析,エピゲノム解析などに使用することができる。本稿ではマルチオミクス解析を可能にする,C1システムにょるシングルセル解析の技術的な進展について解説する。