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Genome-wide association studies for corneal and refractive astigmatism in UK Biobank demonstrate a shared role for myopia susceptibility loci

机译:基因组 - 英国角膜和屈光散光的基因群协会研究表明了近视敏感性锁骨的共同作用

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摘要

Previous studies have suggested that naturally occurring genetic variation contributes to the risk of astigmatism. The purpose of this investigation was to identify genetic markers associated with corneal and refractive astigmatism in a large-scale European ancestry cohort (UK Biobank) who underwent keratometry and autorefraction at an assessment centre. Genome-wide association studies for corneal and refractive astigmatism were performed in individuals of European ancestry ( N ?=?86,335 and 88,005 respectively), with the mean corneal astigmatism or refractive astigmatism in fellow eyes analysed as a quantitative trait (dependent variable). Genetic correlation between the two traits was calculated using LD Score regression. Gene-based and gene-set tests were carried out using MAGMA. Single marker-based association tests for corneal astigmatism identified four genome-wide significant loci ( P ?
机译:以前的研究表明,天然存在的遗传变异有助于散光的风险。本调查的目的是鉴定与在评估中心的大规模欧洲血统队列(英国Biobank)中与角膜和屈光散光相关的遗传标记,以及在评估中心进行胃浸术。在欧洲祖先的个体中进行基因组和屈光散光的研究(分别分别为n?= 86,335和88,005),具有平均角膜散光或屈光度的眼睛,分析为定量性状(依赖变量)。使用LD分数回归计算两个特征之间的遗传相关性。使用岩浆进行基于基因的基因和基因设定试验。基于角膜散域的基于单个标记的关联试验鉴定了在ZC3H11B(1Q41),LINC00340(6P22.3),HERC2 / OCA2附近的四个基因组宽的基因座(P?<β5≤x≤10_(α8)),HERC2 / OCA2( 15Q13.1)和NPLOC4 / TSPAN10(17Q25.3)。这些基因座中的三种也表现出与屈光散光的基因组显着关系:LINC00340,Herc2 / OCA2和NPLOC4 / Tspan10。角膜和屈光散光之间的遗传相关性为0.85(标准误差?= 0.068,P?=?1.37?×10 _(?35))。在这里,我们已经进行了最大的角膜和屈光散光的基因组 - 范围内的基因组和迄今为止的四种新型基因座,其中两种新的基因座,其中两种是屈光散发的新型基因座。这些基因座以前展示了与轴向长度(ZC3H11B),近视(NPLOC4),球形等效折射误差(LINC00340)和眼睛颜色(HERC2)相关联的关联。这些新候选基因对于散光的共同作用引入了近视和散光的共同遗传易感性。

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