Zastosowanie techniki ilosciowego PCR z analiza krzywych topnienia (qPCR-HRM) do rozrózniania polskich lagodnych i zóltaczkowych patotypów wirusa mozaiki pepino (Pepino mosaic virus, PepMV)

摘要

Wirus mozaiki pepino (PepMV) jest groznym patogenem powodujacym znaczne straty w uprawie szklarniowej pomidora w wie regionach swiata. Jednym z charakterystycznych objawów obecnosci wirusa w roslinie sa zóltaczkowe przebarwienia blaszek, który czesto towarzyszy uszkodzenie owoców. Za ich powstawanie odpowiedzialne sa dwie niezalezne mutacje punktowe w genie kodujacyi bialko plaszcza (CP): G463AA/A463AA (155 aa) i GA497U/GG497U (166 aa). W przeprowadzonych badaniach wykorzystano qPCR-HRM c rozrózniania lagodnych i zóltaczkowych patotypów. Zaprojektowano startery, amplifikujace fragment genu kodujacego CP, w któryi znajduja sie obie mutacje zóltaczkowe. Przeanalizowano 18 izolatów, pochodzacych z obiektów szklarniowych na terenie calego kraji Wykonane doswiadczenia potwierdzily skutecznosc zaprojektowanych starterów do róznicowania analizowanych patotypów. Technika 1 moze byc z powodzeniem stosowana do rozrózniania lagodnych i zóltaczkowych patotypów PepMV na terenie naszego kraju.