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Genome Resource for the Huanglongbing Causal Agent 'Candidatus Liberibacter asiaticus' Strain AHCA17 from Citrus Root Tissue in California, USA

机译:来自加利福尼亚州加利福尼亚州柑橘根组织的黄龙兵因果药物的基因组资源,来自柑橘根组织的AHCA17

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摘要

'Candidatus Liberibacter asiaticus' is the unculturable causative agent of citrus huanglongbing disease. Here, we report the first citrus root metagenome sequence containing the draft genome of 'Ca. L. asiaticus' strain AHCA17, obtained from a pummelo tree in California. The assembled genome was 1.2 Mbp and resulted in 37 contigs (N-50 = 158.7 kbp) containing 1,057 predicted open reading frames and 45 RNA-coding genes. This draft genome will provide a valuable resource in further study of 'Ca. L. asiaticus' genome diversity and pathogen epidemiology.
机译:'Candidatus Libibacter Asiaticus'是柑橘黄龙疾病的不脱除致病因子。 在这里,我们报告含有CA的基因组草稿的第一个柑橘根梅毒组序列。 L. Asiaticus'菌株AHCA17,从加利福尼亚州的Pummelo树上获得。 组装的基因组为1.2Mbp,得到37个葡萄片(N-50 = 158.7kbp),含有1,057个预测的开放阅读框和45个RNA编码基因。 该基因组草案将在进一步研究'CA的进一步研究中提供有价值的资源。 L. Asiaticus'基因组多样性和病原体流行病学。

著录项

  • 来源
    《Plant Disease》 |2020年第3期|共3页
  • 作者单位

    Anim &

    Plant Hlth Inspect Serv USDA Plant Protect &

    Quarantine Sci &

    Technol Beltsville MD 20737 USA;

    Anim &

    Plant Hlth Inspect Serv USDA Plant Protect &

    Quarantine Sci &

    Technol Beltsville MD 20737 USA;

    Anim &

    Plant Hlth Inspect Serv USDA Plant Protect &

    Quarantine Sci &

    Technol Beltsville MD 20737 USA;

    Calif Dept Food &

    Agr Plant Pests Diagnost Branch Sacramento CA 95814 USA;

    Anim &

    Plant Hlth Inspect Serv USDA Plant Protect &

    Quarantine Sci &

    Technol Beltsville MD 20737 USA;

    Anim &

    Plant Hlth Inspect Serv USDA Plant Protect &

    Quarantine Sci &

    Technol Beltsville MD 20737 USA;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 植物保护;
  • 关键词

    citrus; metagenomics; prokaryotes;

    机译:柑橘类;Metagenomics;原核生物;

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