ロングリードシークェンサ一のインパク卜2017

摘要

2000年ヒトゲノム概略情報はキヤビラリ一型シ一 クェンサ一（ABI 3730)により達成された。その 後コスト削減のため大規模並行Massive Parallel Sequencingを優先する次世代シークェンサ一 NGS ： Next Generation Sequencer (Roche454, lllumina, ABI SOLiD等）が開発された。しかし NGSは最大読取長400塩基のためヒ卜ゲノムで 頻出する繰返し，相同配列等の構造多様性に対応 できなレ、。この欠陥を越えるのがロングリードシー クェンサ一である。代表的なPacBioは最大銃取 長9.2万塩基で，長いDNAを読み通して構造多様 性に対応し，対照配列不要のde Novo解析が可能 となった。またNGSと異なりPCR增幅しないの で原理的エラーが少なく ，重複度を上げれば精度 を上げる事が出来る（99.999%以上)。現時点で 10Mb以下の微生物やウィルスゲノムは完全全塩 基配列解析が可能である。既に世界の探索ゲノム 研究はロングリ一ドが基調となり，我が国は3年 から5年の運れを取った状況にある。