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Experimental study and DFT calculation for the strength of intermolecular interactions in Schiff base with the phenylarsonic acid scaffold

机译:实验研究与DFT计算在苯甲酸支架中Schiff碱分子间相互作用的强度计算

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摘要

The crystal structure and supramolecular architectures of Schiff bases derived from the o-arsanilic acid, (E)-(2-(4-hydroxybenzylidene)aminophenyl)arsonic acid(I); (E)-(2-(4-methoxybenzylidene )aminophenyl )arsonic acid (II) and (E)-(2-(3-cyanobenzylidene)aminophenyl)arsonic acid (III) are reported. The intermolecular interactions, supramolecular architectures, and molecular conformations are compared with the (E)-(2-(2-hydroxybenzylidene)aminophenyl)arsonic acid(IV) to evaluate how different substituents influence the crystal packing. In the solid state, the O-H center dot center dot center dot O hydrogen bonding interaction predominantly stabilizes the crystal structures of I-IV. Further, the weak intermolecular C-H center dot center dot center dot O, C-H center dot center dot center dot N, C-H center dot center dot center dot pi, pi center dot center dot center dot pi and H center dot center dot center dot H contacts form a self-assembled motif. Various intermolecular interactions exist in I-IV and their energies are quantified using PIXEL DFT and QTAIM analysis. The variant and invariant arsanilic acid dimers are observed in I-IV. The distribution of electrostatic potential on the molecular surface is found to be asymmetric nature in I-IV. The relative contributions of various intermolecular contacts in the I-III and the closely related analog (IV) are quantified by using Hirshfeld surface analysis and the decomposed 2D fingerprint plots. The total lattice energy of compound III is higher than the other compounds. It is due to the cyano substitution in III because the -CN group participates in the C-H center dot center dot center dot N interactions which favored very compact packing. Also, the contribution of intermolecular H center dot center dot center dot H, O center dot center dot center dot H/H center dot center dot center dot O, and C center dot center dot center dot H/H center dot center dot center dot C contacts are drastically reduced in III when compar
机译:衍生自O-芳酸甲酸(E) - (e) - (2-(4-羟基苄基)氨基苯基)芳索膦酸(I)的席氏碱的晶体结构和超分子架构; (e) - (2-(4-甲氧基亚苄基)氨基苯基)芳膦酸(II)和(E) - (2-(3-氰基苄基)氨基苯基苯基苯基苯基)芳膦酸(III)。将分子间相互作用,超分子架构和分子构象与(e) - (2-(2-羟基苄基)氨基苯基)芳膦酸(IV)进行比较,以评估不同的取代基如何影响晶体包装。在固态中,O-H中心点中心点中心点O氢键相互作用主要稳定I-IV的晶体结构。此外,弱分子CH中心点中心点中心点O,CH中心DOT中心点中心点N,CH中心点中心点中心点PI,PI中心点中心点中心点PI和H中心点中心点中心点HOST中心DOT H与形成一个自组装的主题。 I-IV中存在各种分子间相互作用,并且它们的能量是使用像素DFT和Qtai毒分析的量化。在I-IV中观察到变体和不变的砷酸二聚体。发现分子表面上的静电电位分布在I-IV中是不对称的。通过使用HIRSHFELD表面分析和分解的2D指纹图来量化I-III和密切相关的模拟(IV)中各分子触点的相对贡献。化合物III的总晶格能量高于其他化合物。它是由于III中的氰基取代,因为-CN集团参与C-H中心点中心点中心点N相互作用,这有利于非常紧凑的包装。此外,贡献分子间H中心点中心点中心点H,O中心点中心点中心点H / H中心点中心DOT中心DOT O,以及C中心点中心点中心点H / H中心点中心点中心点C触点在一起时,III急剧下降

著录项

  • 来源
    《Journal of Molecular Structure 》 |2019年第2019期| 共17页
  • 作者单位

    Benemerita Univ Autonoma Puebla Inst Ciencias Unidad Polimeros &

    Elect Organ Va13-Ecocampus Valsequillo Independencia 02 Sur San Pedro Zacachimalpa Pue Mexico;

    Benemerita Univ Autonoma Puebla Inst Ciencias Unidad Polimeros &

    Elect Organ Va13-Ecocampus Valsequillo Independencia 02 Sur San Pedro Zacachimalpa Pue Mexico;

    Benemerita Univ Autonoma Puebla Inst Ciencias Unidad Polimeros &

    Elect Organ Va13-Ecocampus Valsequillo Independencia 02 Sur San Pedro Zacachimalpa Pue Mexico;

    Benemerita Univ Autonoma Puebla Inst Ciencias Unidad Polimeros &

    Elect Organ Va13-Ecocampus Valsequillo Independencia 02 Sur San Pedro Zacachimalpa Pue Mexico;

    SASTRA Deemed Univ Sch Chem &

    Biotechnol Dept Bioinformat Biomol Crystallog Lab Thanjavur 613401 India;

    Benemerita Univ Autonoma Puebla Inst Ciencias Unidad Polimeros &

    Elect Organ Va13-Ecocampus Valsequillo Independencia 02 Sur San Pedro Zacachimalpa Pue Mexico;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 分子结构 ;
  • 关键词

    Arsanilic acid derivatives; Schiff base; Hydrogen bonds; Weak non-covalent interactions; PIXEL; Hirshfeld surface; QTAIM analysis;

    机译:砷酸衍生物;席克夫基地;氢键;弱的非共价相互作用;像素;Hirshfeld表面;qtaim分析;

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