КОМПЕНСАЦИЯ РАЗЛИЧИЯ ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКОЙ ПОДВИЖНОСТИ ФЛУОРЕСЦЕНТНО-МЕЧЕНЫХ ФРАГМЕНТОВ ДНК ПРИ ГЕНЕТИЧЕСКИХ АНАЛИЗАХ

摘要

В статье предложен способ компенсации различия электрофоретической подвижности флуоресцентномеченых фрагментов ДНК при определении нуклеотидной последовательности. Определены неравномерности исходной последовательности пиков. Выполнена оптимизация компенсирующих параметров для каждого цветового канала. Оценены результаты компенсации различия электрофоретической подвижности флуоресцентно-меченых фрагментов ДНК, при этом показано, что погрешности определения временного положения пиков значительно уменьшаются и имеют случайный характер. На конкретном примере выполнена оптимизация параметров временного сдвига пиков для каждого цветового канала и построены уточненные графики в диапазоне до 300 нуклеотидов. С целью расширения диапазона применимости предложенного способа можно использовать калибровку и линеаризацию горизонтальной оси. Предложенный способ обеспечивает надежное определение пропущенных и "липших" пиков.