Fragment based drug discovery

摘要

Fragment based drug discovery (FBDD)は，こ こ10年間に，創薬研究におけるリ一ド化合物取得 の有力な手法として注目されるようになってきた. このアプローチは，フラグメントと呼ばれる分子量 300未満の低分子化合物から出発する.FBDDの始 まりは，1990年代初めに遡り，X線解析構造や フアミリー内の既知3次構造情報より作成したホモ ロジーモデルを基に，タンパク質表面に各種フラグ メントを発生させて化合物デザインを行った.我々 も1990年代初めからフラグメントからの化合物創 出を開始し，ハーバ一ド大Karplus教授らの開発 したプログラムMCSSを用いて，タンパク質表面 上のフラグメントの安定な位置を検索し，複数の フラグメントの安定位置を求めた.