ПРИМЕНЕНИЕ СТРУКТУРНЫХ MNA-ДЕСКРИПТОРОВ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ПРОФИЛЕЙ БЕЛКОВЫХ СЕМЕЙСТВ

摘要

Предложен новый подход к составлению профилей белковых семейств, в котором аминокислоты представлены множествами MNA-дескрипгоров, а множественное выравнивание для составления профиля формируется из парных пространственных совмещений белковых структур. Оценка сходства последовательности с профилем семейства получена на основе сопоставлений множеств MNA-дескршпоров. Проведен анализ применимости такого подхода к прогнозу функции белка по аминокислотной последовательности. Рассчитаны профили белковых семейств трипсина, субтилизина и цитохрома Р4.50 и проведен поиск профильных соответствий по базе данных SWISSPROT. Полученные результаты показывают, что описываемый подход может бытьприменен к задачам функционального аннотирования белков по аминокислотным последовательностям.