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日本人結節性硬化症患者10人のTSC遺伝子診断:臨床応用のための系統的遺伝子変異解析法の開発と検出感度の検定

机译:10例日本结节性硬化症患者的TSC基因诊断:系统的基因突变分析方法在临床中的应用及检测灵敏度的测试

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摘要

結節性硬化症は,脂,皮膚,腎臓,心臓を中心に全身のあらゆる臓署別こ過誤膿を形成する常染色体優性退伝病である.疾患者任遺伝子TSC2, TSC2が同定され既に様々な遺伝子変異が報告されているが,変異のホットスポットがない,微細変異から大欠失まで変異のバリエーションに富む,体細胞モザイク症例が少なからず存在する,などの理由により現実には遺伝子診断は難航する.また変異スクリーニングに多用される1本鎖高次構造多型(single - strand confermational polymorphism,sscp)法, Hetero duplex (HD)法の変異検出感度に関しても不明である.本研究では日本人結節性硬化症患者10名を対像にSSCP法, HD法,ダイレクトシークエンス法, Long PCR法,定量的サザンプロット法を組み合わせた系統的アルゴリズムに従った遺伝子儲析を行った.その結果, 2例でTSCl変異(スプライス変異,大欠失), 6例でTSC2変異(大欠失,スプライス変異,ミスセンス変異,フームシフト変異3例)が同定された. TSC1の大欠失はモザイクであり, TSC2のミスセンス変異は腫瘍のみに認められた.一方で.,対象患者の全てのTSC翻訳領域エクソンの塩基配列を決定し, SSCP法, HD法の感度検定を行った.変異検出率は各々6/14 (43%), 5/14 (36%)であったが,互いに相補的な傾向が見られ両者を合わせた感度は9/14 (64%)に上昇した"臨床症状と遺伝子変異との相関ではTSO1変異を持つ症例とTSC2モザイク例で明らかに軽症の傾向がみられた"今回の結果と過去の報告より本邦においてもTSC変異のホットスポットは存在せず,エクソン毎のPCRをべースとしたスクリーニング法では検出し得ない大欠失も存在するため, DNA診断の際には各種検査法を合理的に配置した系統的な解析が必須であると結論された.
机译:结节性硬化症是一种常染色体显性遗传性癫痫病,其形成以脂肪,皮肤,肾脏和心脏为中心的全身所有内脏功能障碍,已经确定了致病基因TSC2和TSC2,尽管已经报道了基因突变,但实际上,由于缺乏突变热点,从微小突变到大缺失的广泛多样的突变以及不多的体细胞镶嵌病例的存在,基因诊断很困难。此外,本研究还不清楚单链商定多态性(sscp)方法和常用于突变筛选的异双链体(HD)方法的敏感性。结合SSCP法,HD法,直接测序法,长PCR法和定量Southern plot法,采用系统算法对10例硬化症患者进行基因分析,结果2例在6例病例中发现了TSC1突变(剪接突变,主要缺失),在3例病例中鉴定了TSC2突变(主要缺失,剪接突变,错义突变和Foomshift突变)。仅在肿瘤中发现了错义突变,另一方面,确定了目标患者中所有TSC翻译区外显子的碱基序列,并进行了SSCP法和HD法的敏感性测试,突变检测率分别为6/14。尽管它们分别是(43%)和5/14(36%),但它们往往是互补的,并且组合敏感性增加到9/14(64%)。在TSO1突变和TSC2镶嵌的情况下,明显有轻度疾病的趋势。“从这个结果和过去的报道来看,日本没有TSC突变的热点,每个外显子都使用PCR。由于存在一些无法通过筛选方法检测到的大缺失,因此得出结论,合理安排各种测试方法的系统分析对于DNA诊断至关重要。

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