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分子生物学的手法を用いたCryptosporidiumの種および遺伝子型鑑別法の比較と文献的考察

机译:利用分子生物学技术对隐孢子虫种类和基因分型方法进行比较和文献综述

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摘要

クリプトスポリジウム症の患者からは,形態的に区別することができない様々な種または遺伝子型が検出されている.種と遺伝子型を正確に鑑別することは感染源の特定や予防対策上重要である.本研究では,クリプトスポリジウムの種および遺伝子型を鑑別する諸方法の有効性を,患者由来株とC.pawum HNJ-1株を用いて比較するとともに,文献的に検討した.Cryptosporidiumの18SrRNA,COWP,HSP70,Poly-TおよびTRAP-C1遺伝子は,各PCR法により全株で増幅され,そのRFLPパターンは患者由来株間で一致し,C.parvumヒト型のパターンを示した.また,HNJ-1株のパターンは患者由来株とは明らかに異なり,C.parvumウシ型のパターンと一致した.一方,18SrRNA遺伝子のダイレクトシーケンスでは,患者由来株とHNJ-1株はC.parvumのヒト型とウシ型のシーケンスに各々一致した.文献的に, PCR-RFLP法によるヒト型やウシ型のパターンは他種あるいは他の遺伝子型と同一であり,鑑別には限界があるものと考えられた.一方,18SrRNAまたはCOWP遺伝子のシーケンスは,種および遺伝子型ごとに異なることが知られており,これらの遺伝子をダイレクトシーケンスすることで,クリプトスポリジウムを正確に鑑別できるものと考えられた.
机译:在隐孢子虫病患者中已检测到各种形态上无法区分的物种或基因型,准确区分物种和基因型对于确定感染源和预防措施很重要。在这项研究中,使用患者来源的菌株和C. pawum HNJ-1菌株比较了区分隐孢子虫种类和基因型的各种方法的有效性,并在文献中进行了检验。每种PCR方法均在所有菌株中扩增了COWP,HSP70,Poly-T和TRAP-C1基因,它们的RFLP模式在患者来源的菌株中是一致的,显示了小隐孢子虫人形。一种菌株的模式与患者来源的菌株明显不同,并且与小牛隐球菌牛型的模式一致。另一方面,在18S rRNA基因的直接序列中,患者来源的菌株和HNJ-1菌株是人小肠隐球菌的类型。它们各自与牛型序列匹配,在文献中,通过PCR-RFLP方法的人型和牛型模式与其他物种或基因型相同,并且认为分化受到限制。另一方面,已知每种物种和基因型的18S rRNA或COWP基因的序列都不同,并且认为可以通过对这些基因进行直接测序来准确区分隐孢子虫。

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