家畜育種の理論とその応用（85）－QTLの探索－

摘要

家畜における産肉性や産乳量等の量的形質には複数のQTLが関与しており，それらの効果の大きさはさまざまである。さらには，複数のQTLの間にエビスタシス（epistasis）と呼ばれる交互作用が存在する場合もあり，量的形質の遺伝的な背景はきわめて複雑であると考えられる。 これまでに見てきたInterval mapping法は，形質に関与するQTLを1個ずつ個別に検出するための方法であり，比較的効果の大きいQTLを検出する能力は高いが，効果の小さいQTLについては，他のQTLの効果や環境効果に隠れてしまうために，見逃す可能性も高い。 もちろん，効果の大きいQTLが検出されれば，その情報をもとに遺伝的能力の高い個体を効率的に選抜することが可能であり，家畜育種の観点から見るとInterval mapping法は有用なQTL探索手法の一つであるといえる。 しかしながら，量的形質の複雑な遺伝構造をより詳細に解明するためには，効果の小さなQTLについてもできるだけ多くを効率的に検出し，さらにはQTL間のエビスタシスをも見出す必要がある。 そのためには，QTL解析の統計モデルにおいて単一のQTLのみを含むInterval mapping法では不十分であり，複数のQTLを同時に考慮したモデルにもとづくQTL探索の手法が必要となる。 本章では，複数QTLの同時検出のためのQTL探索手法について見ていくことにする。 QTLの探索を行う家系としては，2品種の交雑に由来するF2家系を考えるものとする。