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Escaping free-energy minima

机译:逃逸自由能最小值

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摘要

We introduce a powerful method for exploring the properties of the multidimensional free energy surfaces (FESs) of complex many-body systems by means of coarse-grained non-Markovian dynamics in the space defined by a few collective coordinates. A characteristic feature of these dynamics is the presence of a history-dependent potential term that, in time, fills the minima in the FES, allowing the efficient exploration and accurate determination of the FES as a function of the collective coordinates. We demonstrate the usefulness of this approach in the case of the dissociation of a NaCl molecule in water and in the study of the conformational changes of a dialanine in solution.
机译:我们引入了一种强大的方法,可以通过由一些集合坐标定义的空间中的粗粒度非马尔可夫动力学来探索复杂多体系统的多维自由能表面(FES)的特性。这些动力学的一个特征是存在历史相关的潜在术语,该术语随时间填充了FES中的最小值,从而可以根据集体坐标有效地探索和准确确定FES。我们证明了该方法在NaCl分子在水中解离的情况下以及在溶液中二烷胺的构象变化研究中的有用性。

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