Some Software’s Used in DNA Sequencing Based Haplotype Analysis

摘要

Genetik kaynaklar?n ve ?e?itlili?in belirlenmesi ?slah programlar?n?n ilk ad?m?n? te?kil eder. ?stenilen ?zelliklerin seleksiyonuna ba?lamadan ?nce mevcut genetik potansiyelin belirlenmesini ve genotipik de?erlerin tespitini sa?layan bir?ok moleküler y?ntem kullan?lmaktad?r. PCR teknolojisine dayal? bir?ok moleküler y?ntem (RAPD, RFLP, AFLP, SSR ve DNA dizi analizi vb.) kullan?larak popülasyonlar?n?n tan?mlanmas?, verim ve diren? ile ilgili genlerin belirlenmesi, filogenetik ili?kilerin ortaya konulmas? gibi konularda yo?un ?al??malar sürdürülmektedir. Buna paralel olarak moleküler y?ntemlerden sa?lanan veri setlerinin analizleri i?in bir?ok yaz?l?m geli?tirilmi? ve biyoinformatik bilim alan? do?mu?tur. Bu ?al??mada, DNA dizi analizleri sayesinde SNP’lerin (Single Nucleotide Polymorphism’s=Tek Nükleotid Polimorfizm) belirlenerek haplotip analizlerinin yap?lmas?, popülasyonlar aras? ve popülasyonlar i?i genetik uzakl?klar?n hesaplanmas? ve filogenetik ili?kilerin belirlenmesi i?in kullan?lan baz? yaz?l?mlar ve analizleri hakk?nda bilgi verilmesi ama?lanm??t?r.