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Epidemiology, molecular characterization and resistance to antimicrobials of Escherichia coli isolated from South-Brazilian pig herds

机译:从南巴西猪群分离的大肠杆菌的流行病学,分子特征和耐药性

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摘要

Colibacillosis is an enteric disease with a major impact to the swine industry and is caused by enterotoxigenic strains of Escherichia coli. Forty clinical isolates from pigs with diarrhea and 13 environmental isolates were analysed regarding their genotypic profile, genetic relationship and antibiotic resistance. The most prevalent gene was Stb, identified in 50% of the isolates from clinical cases, and Sta and Lt were detected in 35% of them. Among the adesine factors investigated, F18 was found in 27.5% of the E. coli strains. The ERIC-PCR technique used for epidemiological characterization of the isolates did not show the expected discriminatory power. However, the test allowed separation of the isolates in groups, but did not evidence groups related to virulence factors. In the susceptibility test, the highest values for resistance were to tetracycline, in 88.6%. The index of multiple resistance to antimicrobials varied from 0 to 0.69. Index terms: Escherichia coli, genotypic profile, resistance.     INTRODUÇÃO A colibacilose é a enfermidade entérica de maior impacto na suinocultura, sendo ocasionada por cepas enterotoxigênicas de Escherichia coli (ETEC). Para o desenvolvimento da doença as bactérias aderem-se à mucosa intestinal e produzem uma ou mais enterotoxinas (Lt, Sta e Stb), que levam ao desenvolvimento de diarréia e desidratação, podendo resultar na morte dos animais. Os tipos de adesinas comumente associados com a doença são K88 (F4), K99 (F5), 987P (F6) e F41 (Dean-Nystrom et al. 1997, Bertschinger & Fairbrother 1999). Somente o isolamento de E. coli a partir de amostras de fezes e conteúdo intestinal não é suficiente para o diagnóstico da enfermidade. Nesse sentido, as técnicas de soroaglutinação, ELISA, imunofluorescência e PCR (genotipificação) podem ser empregadas para a biotipificação de adesinas e toxinas (Wills 2000). A técnica de ERIC (Enterobacterial repetitive intergenic consensus) é baseada na análise de seqüências cromossomais repetidas, que tem sido usada para a caracterização clonal de diferentes espécies de enterobactérias e para o estudo da relação genética entre isolados. Entretanto, o ERIC-PCR tem sido utilizado com êxito para a diferenciação clonal de cepas de Shigella sonnei, Salmonella typhimurium e Vibrio cholerae (Versalovic et al. 1991, Rivera et al. 1995), e no estudo de variabilidade genética de E. coli patogênicas para aves (Silveira et al. 2002). O uso de fármacos antimicrobianos para o controle e profilaxia de enfermidades bacterianas em suínos é amplamente difundido. Porém, essa prática está associada à presença de resíduos de antibióticos nos alimentos de origem animal e seleção de bactérias resistentes, trazendo sérios riscos à saúde pública (Dunlop et al. 1998). Os objetivos deste estudo foram investigar o perfil genotípico através da PCR e o índice de resistência em amostras de E. coli provenientes de isolados clínicos e ambientais, além de caracterizar epidemiologicamente os isolados de E. coli, determinando uma relação genética entre os isolados pelo uso do ERIC-PCR e da genotipificação.   MATERIAL E MÉTODOS Cepas bacterianas Quarenta isolados clínicos de suínos provenientes de granjas da região sul do Brasil e 13 isolados ambientais foram utilizados neste trabalho. Os isolados clínicos foram obtidos de fezes, intestino delgado e fígado de suínos com diarréia, remetidos ao laboratório de Bacteriologia da UFSM. Os isolados ambientais foram obtidos de duas amostras de água do bebedouro, uma da esterqueira, três de fezes de animais sadios, um de inseto, um de swab da parede da granja, três de swabs do piso e duas da ração ofertada aos animais. As amostras ambientais foram coletadas em uma granja na cidade de Coronel Freitas, Santa Catarina. Os isolados foram semeados em meios de cultura ágar MacCon
机译:大肠杆菌淋病是一种对猪业产生重大影响的肠道疾病,由大肠杆菌的产肠毒素菌株引起。分析了来自腹泻猪的40种临床分离株和13种环境分离株的基因型谱,遗传关系和抗生素抗性。最流行的基因是Stb,在临床病例的50%分离株中鉴定出,其中Sta和Lt在35%的分离株中检出。在所研究的腺苷因子中,在27.5%的大肠杆菌菌株中发现了F18。用于分离株的流行病学表征的ERIC-PCR技术未显示出预期的区分能力。但是,该测试允许将分离株分为几组,但没有证据表明与毒力因子相关的组。在药敏试验中,最高抗药性为四环素,为88.6%。多种对抗菌素的抵抗指数从0到0.69不等。索引词:大肠杆菌,基因型谱,抗药性。简介大肠埃希菌是一种大肠杆菌,是大肠杆菌的主要侵害菌,是大肠杆菌的大肠杆菌(ETEC)。肠胃粘膜细菌,肠粘膜细菌和肠胃粘膜细菌(Lt,Sta e Stb),肠胃细菌,肠胃粘膜细菌,肠胃粘膜细菌和肠胃粘膜细菌。 OS88,K99(F5),987P(F6)和F41(Dean-Nystrom等,1997; Bertschinger和Fairbrother 1999)。大肠杆菌的肠衣,肠衣和肠球菌的肠溶性肠炎。内塞·森迪多(Nesse sentido),如tecnicas desoroaglutinação,ELISA,免疫荧光PCR(genotipificação)荚膜生化毒素(paradeificaçãode adesinas e toxinas)(Wills 2000)。肠道细菌重复性基因间共识)是一种重复性的基础知识,是一种细菌学上的无性系,而肠道菌种是很容易被消化的。 Entretanto,ERIC-PCR s utilisado com.to adiferenciaçãosepas de cepas de cepas so sonnei,Salmonella typhimurium e Vibrio cholerae(Versalovic et al.1991,Rivera et al.1995),无致病性大肠杆菌。 patogênicaspara aves(Silveira et al。2002)。我们使用了抗微生物的抗菌素产品,并成功地将细菌涂在了底粉上。抵抗动物的细菌,反抗细菌的抗微生物,登革热等(Dunlop等人,1998年)。进一步研究基因组突变的能力,并从环境中分离出大肠杆菌。 ERIC-PCR和遗传提示。物料E巴西绿脓杆菌Quarant isoladosclínicosdesuínosprovientesde granjas daregiãosul do Brasil e 13 isolados Environmentalais foram utilizados neste trabalho。乌兹别克斯坦的封建法律组织,UFS的细菌鉴定所,肠蠕动病菌,肠蠕动病菌。 Os isolados Environmentalais foram obtidos de duas amostras deáguado bebedouro,uma da esterqueira,feêsde fezes de animais sadios,um de inseto,um de swab da parede da granja,trêsde swabs do piso e duas daraçãisofertada aos aos。在圣卡塔琳娜州的科罗内尔·弗雷塔斯(Coronel Freitas),作为环境的一份荣誉。 Os isolados foram semeados em meios de culturaágarMacCon

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