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【24h】

Ocorrência e variabilidade genética do Tomato severe rugose virus em tomateiro e piment?o no Estado de S?o Paulo

机译:圣保罗州番茄和甜椒中番茄严重皱纹病毒的发生和遗传变异

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摘要

Um levantamento para avaliar a ocorrência de begomovírus nas culturas de piment?o e tomateiro no estado de S?o Paulo foi realizado entre janeiro/2007 e julho/2008. O DNA total de amostras de piment?o (710) e de tomateiro (103) foi extraído e a presen?a de begomovírus foi testada por PCR. Paralelamente, as mesmas amostras foram avaliadas por amplifica??o por círculo rolante (RCA) seguidas de PCR, e algumas amostras positivas analisadas por RCA-RFLP com a enzima de restri??o HpaII, a fim de se conhecer a variabilidade genética dos isolados. Os resultados demonstraram que, para a técnica de PCR, 99 amostras de piment?o (13,94%) e 39 de tomateiro (37,86%) foram positivas para a presen?a de begomovírus, enquanto que por RCA-PCR, 333 (46,90%) de piment?o e 82 (79,61%) de tomateiro mostrando a maior sensibilidade desta técnica. Seqüências correspondentes à regi?o 5' da capa protéica (CP) e um segmento de gene da regi?o intergênica foram analisadas e indicaram apenas a presen?a da espécie Tomato severe rugose virus (ToSRV). Porém, seqüenciamento parcial de clones obtidos a partir de produto RCA de tomateiro permitiu a detec??o de infec??o mista de ToSRV e Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV). Por RCA-RFLP quatro padr?es de restri??o foram observados para o ToSRV em piment?o, enquanto que em tomateiro observaram-se 18 padr?es.Os resultados indicam maior diversidade genética dos begomovírus em tomateiro quando comparada com os de piment?o.
机译:在2007年1月至2008年7月之间,进行了一项调查,以评估圣保罗州胡椒和番茄作物中的牛瘟病毒的发生。提取了辣椒(710)和番茄(103)样品的总DNA,并通过PCR检测了begomovirus的存在。同时,通过滚环扩增(RCA)和PCR对相同样品进行评估,并用限制酶HpaII通过RCA-RFLP分析一些阳性样品,以了解该基因的遗传变异性。隔离的。结果显示,对于PCR技术,99份辣椒(13.94%)和39份西红柿(37.86%)样品中的begomovirus呈阳性,而通过RCA-PCR, 333辣椒(46.90%)和82(79.61%)西红柿显示了该技术的最高灵敏度。分析了对应于蛋白质层(CP)5'区的序列和来自基因间区的基因片段,并仅表明存在番茄重症皱纹病毒(ToSRV)种。然而,从番茄RCA产品获得的克隆的部分测序可以检测ToSRV和番茄黄脉条纹病毒(ToYVSV)的混合感染。通过RCA-RFLP,在辣椒中观察到四种ToSRV的限制性酶切模式,而在番茄中观察到了18种模式,结果表明与番茄相比,番茄中的begomovirus遗传多样性更高。辣椒。

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