机译:比较植物分类学中针对目标序列捕获的分类群特异性位点和一般位点集
Buddlejahybrid enrichmentLamialesPPR genesScrophulariaceaesingle‐copy nuclear genes;
机译:靶向转座后,在果蝇的残留基因座处回收了包含捕获的基因组序列的P元素嵌合体。
机译:3,490 rbcL序列的最大似然分析:综合推断与组特定分类群采样的可伸缩性
机译:植物粉蜥蜴的系统核糖学:来自序列捕获的冲突信号与限制性位点相关的DNA测序
机译:无监督的铰接骨骼提取从单个深度相机捕获的点设置序列
机译:生物序列比较,系统生物学分析及应用
机译:比较植物分类学中针对目标序列捕获的分类群特异性和一般基因座集
机译:图4:(a)一种保守序列,其发生在芯片-SEQ数据集中的46,264个结合位点峰值中的79倍。说明了这种保守序列的突变分布,其中'_'表示该碱度不变; del表示此基础丢失; INS X表示新的基础X插入此基础前面。 (b)列出了几种重复的元素模式。 (c)在第一栏中,示出了由MEME芯片工具(Machanick&Bailey,2011)开采的前五个DNA主题。由CFSP算法发现的相应保守序列列于第二列中。在第三列中,列出了从突变信息转换的特定位置的评分矩阵。 MEME主题与PSSM格式的相似性与PSSM格式之间的相似性通过邮票图章比较工具(Mahony&Benos,2007)计算。这些对相似性的电子值显示在第四列中。 (d)在由GKMSVM描述符聚集的每个组中选择了一个图案,下面列出了CFSP算法的相应主题。 (e)从https://www.encodeproject.org收集的,有附加数据集(文件no:cernff100grl,cenf616irl,conf8.20cer,target:srebf1)。使用MEME工具在每个文件中选择前两个图案,并且我们的算法发现的相应主题如下所示。