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Variabilidad molecular de tres genes del virus del amarillamiento de las venas de la hoja de la papa que infecta Solanum tuberosum, mediante la técnica de polimorfismo conformacional de cadena sencilla

机译:利用单链构象多态性技术研究马铃薯叶脉变黄病毒感染马铃薯的三个基因的分子变异性

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摘要

Potato yellow vein virus o virus del amarillamiento de venas de la hoja de la papa (PYVV) es un virus RNA tripartito (ss+) de la familia Closteroviridae género Crinivirus que causa la enfermedad de amarillamiento de nervaduras de la hoja de papa (PYVD) reduciendo la productividad, entre el 25 % y 50 %. La técnica de polimorfismo conformacional de cadena sencilla (SSCP) ha sido usada para estimar la variabilidad en diferentes especies de virus. En el presente trabajo se analizó la variabilidad molecular de 60 aislados de PYVV a partir de la comparación de tres genes: el gen de la proteína mayor de la cápside (CP), proteína menor de la cápside (CPm) y la proteína de choque térmico (Hsp70). Los aislados se obtuvieron de dos grupos de Solanum tuberosum: 30 del Grupo Phureja (GPh) y 30 del Grupo Andígena (GA), provenientes del departamento de Nari?o, Colombia. Los genes se amplificaron por RT-PCR y los productos purificados se emplearon para SSCP en geles de poliacrilamida. Se detectaron tres perfiles de SSCP para el gen CP, 12 para el CPm y 12 para el Hsp70. Para el GA el perfil más frecuente del gen Hsp70 fue el perfil C (66,6 %) y para el gen CPm fue el IV (33,3 %). Para el gen CP, el patrón uno se encontró en el 93,3 % de los aislados, indicando menor variabilidad. Esta es la primera estimación de variabilidad de PYVV en diferentes genes y a través de una técnica molecular simple.
机译:马铃薯黄脉病毒或马铃薯叶脉黄化病毒(PYVV)是克氏杆菌科克氏杆菌病毒的三方RNA病毒(ss +),可通过减少马铃薯叶脉黄化病(PYVD)生产率介于25%和50%之间。单链构象多态性(SSCP)技术已用于估计不同病毒物种中的变异性。在目前的工作中,通过比较三个基因分析了60个PYVV分离株的分子变异性:主要衣壳蛋白(CP),次要衣壳蛋白(CPm)和热激蛋白。 (Hsp70)。分离物来自两组马铃薯:30个来自Phureja集团(GPh),30个来自Andigena集团(GA),来自哥伦比亚Nari?O部门。通过RT-PCR扩增基因,并将纯化的产物用于聚丙烯酰胺凝胶上的SSCP。 CP基因检测到三个SSCP谱图,CPm检测到12个,Hsp70检测到12个。对于GA,Hsp70基因的最常见特征是特征C(66.6%),而对于CPm基因,它最常见的是IV(33.3%)。对于CP基因,在93.3%的分离物中发现了一种模式,表明变异性较小。这是通过简单的分子技术对不同基因中PYVV变异性的首次估计。

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