Towards a molecular phylogeny for the lichen family Pannariaceae (Lecanorales, Ascomycota)

摘要

The phylogeny of the family Pannariaceae (Lecanorales, lichenized Ascomycota) was investigated using ITS1–5.8S–ITS2 nuclear ribosomal DNA sequences representing 21 species. Phylogenetic estimations were performed using parsimony and a Bayesian Markov chain Monte Carlo (MCMC) tree sampling procedure. Several phylogenetic null hypotheses were tested, also using MCMC. The results indicate that Pannariaceae, as currently treated, is polyphyletic and that Degelia sect. Amphiloma, Fuscopannaria subg. Micropannaria, and Moelleropsis s.str. do not belong in the family. The inclusion of Parmeliella in the Pannariaceae could not be rejected, although it falls outside the family in the optimal trees. Psoroma, Santessoniella, Protopannaria, Fuscopannaria subg. Fuscopannaria, Moelleropsis s.str., and Pannaria unequivocally belong to the family. The Pannaria sphinctrina group belongs in Pannaria despite its green-algal photobiont. Protopannaria pezizoides is not, as sometimes treated, a Pannaria, although a relationship with Psoroma could not be ruled out. In the optimal trees, Moelleropsis s.str. is nested inside Fuscopannaria subg. Fuscopannaria and Santessoniella inside Psoroma, but null hypotheses of their independence from these genera could not be rejected. Pannaria cannot be divided into two monophyletic subgenera, Pannaria and Chryopannaria. The photobiont has changed twice or three times and the ascus apex and hymenial amyloidity twice within the Pannariaceae.Key words: lichens, Pannariaceae, ITS, ribosomal DNA, phylogeny, MCMC.Les auteurs ont examiné la phylogénie de la famille des Pannariaceae (Lécanorales, ascomycota lichénisés), en utilisant les séquences de l'ADN ribosomal de l'ITS1–5.8S–ITS2, représentant 21 espèces. Ils ont effectué des estimations phylogénétiques en utilisant la parcimonie et une méthodologie Bayésienne de MCMC pour échantillonner les branches des dendrogrammes. Plusieurs hypothèses phylogénétiques nulles ont également été testées. Les résultats indiquent que la famille des Pannariaceae, telle qu'actuellement traitée, est polyphylétique et que les Degelia sect. Amphiloma, Fuscopannaria subg. Micropannaria, et Moelleropsis s.str., n'appartiennent pas à cette famille. On ne peut rejeter l'inclusion des Parmeliella dans les Pannariaceae, bien qu'ils se retrouvent en dehors de la famille dans le dendrogramme optimum. LesPsoroma, Santessoniella, Protopannaria, Fuscopannaria subg. Fuscopannaria, Moelleropsis s.str., et Pannaria, appartiennent indiscutablement à la famille. Le groupe des Pannaria sphinctrina appartient au genre Pannaria, bien que son photobionte soit une algue verte. Le Protopannaria pezizoides n'est pas, comme on le traite quelques fois, un Pannaria, bien qu'on ne puisse exclure une relation avec les Psoroma. Dans les dendrogrammes optimums, le Moelleropsis s.str. se retrouve dans le sous-genre Fuscopannaria. Les Fuscopannaria et les Santessoniella appartiennent aux Psoroma bien que les hypothèses nulles concernant leur indépendance de ces genres n'aient pu être rejetées. On ne peut diviser le genre Pannaria en deux sous-genre monophylétiques, les Pannaria et les Chryopannaria. Au sein des Pannariaceae, le photobionte a changé deux ou trois fois, et l'amyloïdie des apex des asques et de l'hyménium, deux fois.Mots clés : lichens, Pannariaceae, ITS, ADN ribosomal, phylogénie, MCMC.[Traduit par la Rédaction]