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Sarment: Python modules for HMM analysis and partitioning of sequences

机译:Sarment:用于HMM分析和序列划分的Python模块

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摘要

Summary: Sarment is a package of Python modules for easy building and manipulation of sequence segmentations. It provides efficient implementation of usual algorithms for hidden Markov Model computation, as well as for maximal predictive partitioning. Owing to its very large variety of criteria for computing segmentations, Sarment can handle many kinds of models. Because of object-oriented programming, the results of the segmentation are very easy to manipulate.
机译:简介:Sarment是一个Python模块包,用于轻松构建和操纵序列分段。它为隐藏的马尔可夫模型计算以及最大的预测分区提供了常用算法的有效实现。由于其用于计算细分的标准种类繁多,Sarment可以处理多种模型。由于采用了面向对象的程序设计,因此分割的结果非常易于操作。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2005年第16期|p.3427-3428|共2页
  • 作者

    Laurent Gueguen;

  • 作者单位

    Laboratoire Biometrie et Biologie Evolutive, (UMR 5558);

    (NRS);

    Univ Lyon 1, 43 bd 11 Nov, 69622 Villeurbanne cedex, France;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 生物科学;生物工程学(生物技术);
  • 关键词

  • 入库时间 2022-08-17 23:50:06

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