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High contiguity genome sequence of a multidrug-resistant hospital isolate of Enterobacter hormaechei

机译:霍马肠杆菌多重耐药医院分离株的高连续性基因组序列

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摘要

BackgroundEnterobacter hormaechei is an important emerging pathogen and a key member of the highly diverse Enterobacter cloacae complex. E. hormaechei strains can persist and spread in nosocomial environments, and often exhibit resistance to multiple clinically important antibiotics. However, the genomic regions that harbour resistance determinants are typically highly repetitive and impossible to resolve with standard short-read sequencing technologies.
机译:背景霍马肠杆菌是一种重要的新兴病原体,也是高度多样的阴沟肠杆菌复合体的关键成员。霍马埃希氏菌菌株可以在医院环境中持续存在和传播,并且通常对多种临床上重要的抗生素表现出抗药性。但是,带有抗性决定簇的基因组区域通常具有高度重复性,无法用标准的短读测序技术解析。

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