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GPURFSCREEN: a GPU based virtual screening tool using random forest classifier

机译:GPURFSCREEN:使用随机森林分类器的基于GPU的虚拟筛选工具

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摘要

>BackgroundIn-silico methods are an integral part of modern drug discovery paradigm. Virtual screening, an in-silico method, is used to refine data models and reduce the chemical space on which wet lab experiments need to be performed. Virtual screening of a ligand data model requires large scale computations, making it a highly time consuming task. This process can be speeded up by implementing parallelized algorithms on a Graphical Processing Unit (GPU).
机译:>背景计算机模拟方法是现代药物发现范例不可或缺的一部分。虚拟筛选是一种计算机内方法,用于完善数据模型并减少需要在其上进行湿实验室实验的化学空间。虚拟筛选配体数据模型需要大规模计算,这是一项非常耗时的任务。通过在图形处理单元(GPU)上实现并行算法可以加快此过程。

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