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Whole genome sequencing data of Escherichia coli isolated from bloodstream infection patients in Cipto Mangunkusumo National Hospital Jakarta Indonesia

机译:从印度尼西亚雅加达的Cipto Mangunkusumo国家医院的血液感染患者中分离出的大肠杆菌的全基因组测序数据

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摘要

Bloodstream infections (BSIs) are some of the most devastating preventable complications in critical care units. Of the bacterial causes of BSIs, is the most common among Enterobacteriaceae. Bacteria resistant to therapeutic antibiotics represent a significant global health challenge. In this study, we present whole genome sequence data of 22 isolates that were obtained from bloodstream infection patients admitted to Cipto Mangunkusumo National Hospital, Jakarta, Indonesia. These data will be useful for analysing the serotypes, virulence genes, and antimicrobial resistance genes of DNA sequences of were obtained using the Illumina MiSeq platform. The FASTQ raw files of these sequences are available under BioProject accession number PRJNA596854 and Sequence Read Archive accession numbers SRR10761126–SRR10761147.
机译:血液感染(BSI)是重症监护病房中最具破坏性的可预防并发症。在BSI的细菌原因中,肠杆菌科最为常见。对治疗性抗生素具有抗性的细菌代表了重大的全球健康挑战。在这项研究中,我们介绍了22株分离株的全基因组序列数据,这些分离株是从印度尼西亚雅加达Cipto Mangunkusumo国家医院收治的血液感染患者获得的。这些数据将有助于分析使用Illumina MiSeq平台获得的DNA序列的血清型,毒力基因和抗菌素耐药基因。这些序列的FASTQ原始文件在BioProject登录号PRJNA596854和序列读取存档登录号SRR10761126–SRR10761147下提供。

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