机译:DNa序列和β-丙氨酸插入的位置与聚酰胺-DNa复合物结合亲和力和动力学的局部效应的相关性
机译:DNA序列的局部作用和β-丙氨酸插入片段的位置与聚酰胺-DNA复合物结合亲和力和动力学的关系
机译:表面等离子体共振生物传感器揭示的DNA错配对聚合酶-DNA复合物结合亲和力和动力学的影响
机译:Hoechst 33258和DAPI结合五个(A / T)4 DNA位点的碱基序列特异性具有动力学证据,表明有超过一种高亲和力的Hoechst 33258-AATT复合物。
机译:DNA双链断裂修复蛋白Ku70 / 80和DNA-PKcs的体外结合动力学通过荧光相关光谱和荧光互相关光谱定量
机译:化合物结构对与呋喃啶有关的未融合芳香族指示剂的亲和力,序列选择性,热力学和与DNA结合方式的影响。
机译:DNA序列相关性塑造非特异性转录因子-DNA结合亲和力
机译:图4:(a)一种保守序列,其发生在芯片-SEQ数据集中的46,264个结合位点峰值中的79倍。说明了这种保守序列的突变分布,其中'_'表示该碱度不变; del表示此基础丢失; INS X表示新的基础X插入此基础前面。 (b)列出了几种重复的元素模式。 (c)在第一栏中,示出了由MEME芯片工具(Machanick&Bailey,2011)开采的前五个DNA主题。由CFSP算法发现的相应保守序列列于第二列中。在第三列中,列出了从突变信息转换的特定位置的评分矩阵。 MEME主题与PSSM格式的相似性与PSSM格式之间的相似性通过邮票图章比较工具(Mahony&Benos,2007)计算。这些对相似性的电子值显示在第四列中。 (d)在由GKMSVM描述符聚集的每个组中选择了一个图案,下面列出了CFSP算法的相应主题。 (e)从https://www.encodeproject.org收集的,有附加数据集(文件no:cernff100grl,cenf616irl,conf8.20cer,target:srebf1)。使用MEME工具在每个文件中选择前两个图案,并且我们的算法发现的相应主题如下所示。