插入序列IS6100介导DNA序列转移的机制研究

摘要

目的 插入序列IS6100与耐药基因转移密切相关,本研究旨在初步探究IS6100转移DNA序列的机制.方法 以Genbank库中已有序列中含两个及两个以上拷贝IS6100序列的质粒或者染色体为研究对象,通过生物信息分析的方法分析各IS6100侧翼的靶位点重复序列(TSD),推测该元件转座酶可能的工作机制.结果 共检索到22条序列,含5条染色体、16条质粒以及1条定位未知的转座子序列.其中有13条序列(59％)来自鞘脂菌属细菌,余下均来自条件致病菌的染色体或质粒.在鞘脂菌属细菌TKS中,IS6100拷贝数可多达29个,且IS6100和鞘脂菌属细菌基因组的GC％均接近60％.共有35条不同的8 bp TSD在这些菌株中出现的频率为2～8次.TSD的GC％含量在13％ ～100％,有87％(30/35)的TSD序列GC％含量均≥50％.这些TSD可同时出现在同一菌株的染色体或质粒内部、同一菌株的染色体和质粒之间、不同菌株的染色体和质粒间.结论 IS6100的产生菌可能为鞘脂菌属细菌.IS6100的作用靶位点没有高度选择性,但仍倾向作用于高GC％含量位点.两个IS6100可以形成复合转座子,转移其间的DNA序列,这些转座事件可以发生在分子间和分子内.