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【2h】

Cumulative Signal Transmission in Nonlinear Reaction-Diffusion Networks

机译:非线性反应扩散网络中的累积信号传输

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摘要

Quantifying signal transmission in biochemical systems is key to uncover the mechanisms that cells use to control their responses to environmental stimuli. In this work we use the time-integral of chemical species as a measure of a network’s ability to cumulatively transmit signals encoded in spatiotemporal concentrations. We identify a class of nonlinear reaction-diffusion networks in which the time-integrals of some species can be computed analytically. The derived time-integrals do not require knowledge of the solution of the reaction-diffusion equation, and we provide a simple graphical test to check if a given network belongs to the proposed class. The formulae for the time-integrals reveal how the kinetic parameters shape signal transmission in a network under spatiotemporal stimuli. We use these to show that a canonical complex-formation mechanism behaves as a spatial low-pass filter, the bandwidth of which is inversely proportional to the diffusion length of the ligand.
机译:量化生化系统中的信号传递是揭示细胞用来控制其对环境刺激反应的机制的关键。在这项工作中,我们使用化学物种的时间积分来衡量网络累积传输时空浓度编码信号的能力。我们确定了一类非线性反应扩散网络,其中某些物种的时间积分可以通过分析来计算。导出的时间积分不需要了解反应扩散方程的解,我们提供了一个简单的图形测试来检查给定的网络是否属于所提议的类别。时间积分公式揭示了动力学参数如何在时空刺激下塑造网络中的信号传输。我们使用这些来表明规范的复合物形成机制表现为空间低通滤波器,其带宽与配体的扩散长度成反比。

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