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A STATISTICAL FRAMEWORK FOR DATA INTEGRATION THROUGH GRAPHICAL MODELS WITH APPLICATION TO CANCER GENOMICS

机译:通过图形模型进行数据整合的统计框架及其在癌症基因组学中的应用

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摘要

Recent advances in high-throughput biotechnologies have generated var-ious types of genetic, genomic, epigenetic, transcriptomic and proteomic data across different biological conditions. It is likely that integrating data from diverse experiments may lead to a more unified and global view of biolog-ical systems and complex diseases. We present a coherent statistical frame-work for integrating various types of data from distinct but related biological conditions through graphical models. Specifically, our statistical framework is designed for modeling multiple networks with shared regulatory mech-anisms from heterogeneous high-dimensional datasets. The performance of our approach is illustrated through simulations and its applications to cancer genomics.
机译:高通量生物技术的最新进展已经产生了跨越不同生物学条件的各种类型的遗传,基因组,表观遗传,转录组学和蛋白质组学数据。整合来自不同实验的数据可能会导致对生物系统和复杂疾病的更加统一和全局的了解。我们提出了一个一致的统计框架,用于通过图形模型整合来自不同但相关的生物学条件的各种类型的数据。具体而言,我们的统计框架旨在通过异构高维数据集中具有共享监管机制的多个网络进行建模。通过仿真及其在癌症基因组学中的应用说明了我们方法的性能。

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