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A meta-analysis of genome-wide association studies identifies 17 new Parkinson’s disease risk loci

机译:对全基因组关联研究的荟萃分析确定了17个新的帕金森氏病风险位点

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摘要

Common variant genome-wide association studies (GWASs) have, to date, identified >24 risk loci for Parkinson’s disease (PD). To discover additional loci, we carried out a GWAS comparing 6,476 PD cases with 302,042 controls, followed by a meta-analysis with a recent study of over 13,000 PD cases and 95,000 controls at 9,830 overlapping variants. We then tested 35 loci (P < 1 × 10−6) in a replication cohort of 5,851 cases and 5,866 controls. We identified 17 novel risk loci (P < 5 × 10−8) in a joint analysis of 26,035 cases and 403,190 controls. We used a neurocentric strategy to assign candidate risk genes to the loci. We identified protein-altering or cis–expression quantitative trait locus (cis-eQTL) variants in linkage disequilibrium with the index variant in 29 of the 41 PD loci. These results indicate a key role for autophagy and lysosomal biology in PD risk, and suggest potential new drug targets for PD.
机译:迄今为止,常见的全变体全基因组关联研究(GWAS)已经确定了帕金森氏病(PD)的24个以上风险位点。为了发现更多的基因座,我们进行了GWAS,将6,476例PD病例与302,042例对照进行了比较,随后进行了荟萃分析,对一项针对9,830个重叠变异的13,000例PD病例和95,000例对照的最新研究。然后,我们在5851个病例和5866个对照的复制队列中测试了35个基因座(P <1×10 -6 )。通过对26,035例病例和403,190例对照进行联合分析,我们确定了17个新的风险基因座(P <5×10 -8 )。我们使用了以神经为中心的策略,将候选风险基因分配给基因座。我们在41个PD基因座中的29个位点中,发现了与连锁不平衡相关的蛋白质改变或顺式表达定量性状基因座(cis-eQTL)变异。这些结果表明自噬和溶酶体生物学在PD风险中的关键作用,并暗示了PD的潜在新药靶标。

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